More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0403 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
174 aa  358  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  93.1 
 
 
174 aa  342  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  69.39 
 
 
170 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  66.44 
 
 
171 aa  217  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  62.26 
 
 
170 aa  214  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3381  redoxin domain-containing protein  44.03 
 
 
171 aa  164  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.9 
 
 
175 aa  158  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  35 
 
 
183 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  34.27 
 
 
176 aa  100  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  34.9 
 
 
168 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  32.54 
 
 
167 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.92 
 
 
168 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  32.12 
 
 
179 aa  97.4  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  30.49 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  33.97 
 
 
184 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.54 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  31.71 
 
 
165 aa  95.5  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  34.84 
 
 
175 aa  94.7  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  30.71 
 
 
173 aa  92  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  31.43 
 
 
173 aa  92.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  30.71 
 
 
173 aa  92  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  31.43 
 
 
173 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  33.54 
 
 
180 aa  92  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  30.13 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.99 
 
 
169 aa  91.7  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2789  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.07 
 
 
376 aa  90.9  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0340892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  36.09 
 
 
166 aa  90.9  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  31.43 
 
 
173 aa  90.9  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  31.43 
 
 
173 aa  90.9  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  31.87 
 
 
180 aa  90.9  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03915  putative thiol:disulfide interchange protein  32.7 
 
 
185 aa  90.9  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.61 
 
 
171 aa  90.9  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  30.71 
 
 
173 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.28 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.76 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  31.43 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  28.73 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  30.71 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  29.79 
 
 
155 aa  89  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  30 
 
 
173 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.03 
 
 
191 aa  88.6  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  35.25 
 
 
171 aa  88.2  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  32.03 
 
 
182 aa  87.4  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2287  putative thiol:disulfide interchange protein  35.94 
 
 
152 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129752  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.27 
 
 
187 aa  87  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1572  hypothetical protein  30.38 
 
 
194 aa  87  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.21 
 
 
191 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  35 
 
 
178 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  31.01 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  32.59 
 
 
174 aa  85.9  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  35 
 
 
182 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  35.71 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1405  putative thioredoxin related protein  30.72 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  32.85 
 
 
172 aa  85.5  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  31.21 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  33.06 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  30 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  30.5 
 
 
155 aa  85.1  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  31.65 
 
 
182 aa  84.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  29.73 
 
 
188 aa  84.7  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  28.92 
 
 
181 aa  84.3  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.06 
 
 
288 aa  84.3  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  28.22 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  36.99 
 
 
155 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3390  hypothetical protein  32.77 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 
409 aa  84  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  31.91 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  31.91 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  31.91 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2528  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.62 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  36.28 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  31.91 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  30.3 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  31.91 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  31.01 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  29.3 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  29.3 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  31.01 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  34.15 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  31.25 
 
 
403 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  31.25 
 
 
403 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  29.73 
 
 
191 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  33.9 
 
 
170 aa  82  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.48 
 
 
189 aa  82  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  29.37 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.93 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30.43 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  36.7 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  36.13 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.75 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  30.33 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  34.51 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  36.7 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  29.73 
 
 
191 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2087  redoxin domain-containing protein  27.46 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0109878  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2293  thioredoxin family protein  31.65 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  34.51 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  28.38 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  34.51 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>