More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0124 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  98.35 
 
 
183 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  95.05 
 
 
183 aa  324  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  92.9 
 
 
184 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  92.35 
 
 
183 aa  316  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  92.86 
 
 
182 aa  294  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  75.31 
 
 
202 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  75.31 
 
 
186 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  75.31 
 
 
186 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  74.07 
 
 
186 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  74.07 
 
 
186 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  74.07 
 
 
186 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  74.07 
 
 
202 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  74.07 
 
 
186 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  60.56 
 
 
183 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  61.33 
 
 
180 aa  227  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  63.74 
 
 
182 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.96 
 
 
174 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  43.41 
 
 
174 aa  151  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  43.96 
 
 
174 aa  151  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  46.9 
 
 
180 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  46.15 
 
 
182 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.11 
 
 
175 aa  145  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  40.56 
 
 
178 aa  144  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  42.25 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.77 
 
 
195 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.46 
 
 
195 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000964008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  40.77 
 
 
195 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  41.73 
 
 
188 aa  124  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  40.77 
 
 
189 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  38.85 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3204  thioredoxin family protein, putative  37.69 
 
 
180 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906791 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  34.55 
 
 
183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  39.53 
 
 
190 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  42.5 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.23 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  40 
 
 
164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  38.76 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0948  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.01 
 
 
182 aa  111  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  38.28 
 
 
167 aa  108  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0676  Redoxin domain protein  38.28 
 
 
165 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  33.08 
 
 
187 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.81 
 
 
188 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  28.74 
 
 
173 aa  98.6  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  34.24 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.1 
 
 
182 aa  96.7  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.21 
 
 
187 aa  95.5  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.61 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
166 aa  92  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1042  thiol:disulfide interchange protein like protein  36.28 
 
 
135 aa  91.7  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.89 
 
 
288 aa  91.3  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.97 
 
 
201 aa  90.9  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.12 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  32.84 
 
 
168 aa  87.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  34.06 
 
 
179 aa  87  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  36.15 
 
 
188 aa  87  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  38.79 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  34.62 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  33.92 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  34.09 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  34.78 
 
 
180 aa  84.3  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  35.71 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.92 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  29.44 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  32.56 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  32.82 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  32 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  33.59 
 
 
160 aa  82  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  32.31 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  33.08 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  33.08 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  32.31 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  32.31 
 
 
173 aa  82  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1378  Redoxin domain protein  34.07 
 
 
220 aa  82  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.677919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.26 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  35.71 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  33.08 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  33.08 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  33.08 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  33.08 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  33.09 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.4 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  35.54 
 
 
165 aa  80.9  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1688  thioredoxin, putative  35.88 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1981  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.11 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0214492  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4448  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.77 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  32.48 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  34.92 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  38.58 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  34.39 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.23 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  31.54 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  35.4 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.63 
 
 
174 aa  79  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  36.5 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  31.54 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>