More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2784 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  100 
 
 
174 aa  350  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  82.76 
 
 
174 aa  308  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  82.76 
 
 
174 aa  307  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  65.52 
 
 
182 aa  201  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  61.9 
 
 
180 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  54.23 
 
 
182 aa  167  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  52.59 
 
 
202 aa  162  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  51.85 
 
 
186 aa  157  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  51.85 
 
 
202 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  51.85 
 
 
186 aa  157  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  51.85 
 
 
186 aa  157  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  51.85 
 
 
186 aa  157  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  51.85 
 
 
186 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  51.85 
 
 
186 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  45.6 
 
 
183 aa  153  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  45.71 
 
 
180 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  49.65 
 
 
183 aa  150  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  50.7 
 
 
183 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  41.62 
 
 
178 aa  150  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.46 
 
 
175 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
184 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  48.59 
 
 
183 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  47.18 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  47.18 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  49.25 
 
 
182 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
195 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.97 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  43.97 
 
 
195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  42.66 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0948  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.75 
 
 
182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  39.38 
 
 
171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  38.78 
 
 
172 aa  121  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3204  thioredoxin family protein, putative  39.72 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.19 
 
 
195 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000964008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  42.96 
 
 
189 aa  118  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  40.62 
 
 
184 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  40.29 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.83 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.44 
 
 
185 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  39.53 
 
 
164 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0676  Redoxin domain protein  37.33 
 
 
165 aa  103  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  38.22 
 
 
167 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  32.92 
 
 
173 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1042  thiol:disulfide interchange protein like protein  40 
 
 
135 aa  94.7  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  33.33 
 
 
183 aa  94.7  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  29.07 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  37.01 
 
 
200 aa  89  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.72 
 
 
191 aa  88.6  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.54 
 
 
188 aa  87.8  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  40.32 
 
 
209 aa  84  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  40.32 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3457  hypothetical protein  36.64 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  32.56 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  34.71 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1906  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.203094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.41 
 
 
188 aa  79  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  29.23 
 
 
329 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.52 
 
 
288 aa  78.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  36 
 
 
277 aa  77.8  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  34.5 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.4 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  36.84 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  34.27 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.67 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5968  Redoxin domain protein  35.94 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.566817  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  29.79 
 
 
203 aa  74.3  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.02 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1829  peroxiredoxin-like  33.53 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000091081  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  32.09 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  34.92 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.55 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  29.31 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.8 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  37.96 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0520  Redoxin domain protein  39.26 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0866  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.97 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  34.13 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  29.94 
 
 
170 aa  72  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  27.47 
 
 
174 aa  72  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  30.09 
 
 
170 aa  72  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  34.75 
 
 
209 aa  72  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  35 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.8 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  35.25 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  35.04 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  37.01 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  29.46 
 
 
220 aa  71.2  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.79 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  36.78 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  25.64 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  38.66 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0984  thioredoxin  31.97 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  33.81 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3091  Redoxin domain protein  33.33 
 
 
203 aa  70.9  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  35.07 
 
 
268 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  28.93 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  34.03 
 
 
200 aa  70.9  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  33.81 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>