More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3550 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
278 aa  524  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2252  putative thiol:disulfide interchange protein  49.45 
 
 
271 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  48.16 
 
 
269 aa  209  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  42.26 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  39.71 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  39.93 
 
 
278 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  42.02 
 
 
278 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2109  redoxin  36.16 
 
 
271 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  39.93 
 
 
278 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  41.42 
 
 
267 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  50.23 
 
 
268 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  41.95 
 
 
290 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  38.91 
 
 
278 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  38.89 
 
 
278 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1703  redoxin domain-containing protein  39.44 
 
 
273 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  32.85 
 
 
277 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  47.21 
 
 
278 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  46.7 
 
 
278 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  38.21 
 
 
279 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2593  putative thiol:disulfide interchange protein  47.45 
 
 
276 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2433  redoxin domain-containing protein  39.85 
 
 
277 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  43.17 
 
 
269 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1412  Redoxin domain protein  42.29 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  39.62 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  38.33 
 
 
332 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  45.33 
 
 
269 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2788  putative thiol:disulfide interchange protein  55.32 
 
 
195 aa  132  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  43.93 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  43.93 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  43.93 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  43.11 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  42.22 
 
 
269 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3733  redoxin domain-containing protein  35.9 
 
 
262 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919007  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3246  redoxin domain-containing protein  34.8 
 
 
266 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  42.34 
 
 
164 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  46.15 
 
 
169 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  34.42 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1492  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.72 
 
 
193 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.68 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.37 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  35.48 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.21 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  44.66 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5883  Redoxin domain protein  41.46 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  38.14 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  39.13 
 
 
180 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  39.13 
 
 
183 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.26 
 
 
183 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2634  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.09 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  41.67 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  32.17 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  37.96 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.69 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  37.29 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  40.41 
 
 
182 aa  72  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  37.41 
 
 
174 aa  72  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1872  heat shock protein DnaJ-like  29.73 
 
 
180 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.506662  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  32.81 
 
 
176 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  38.1 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  36.29 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  25.61 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  33.61 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  28.46 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  35.71 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  27.12 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  27.12 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  27.12 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  27.12 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  27.12 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  26.32 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  40.59 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1408  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  34.82 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  29.13 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  27.97 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.28 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  34.31 
 
 
167 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.97 
 
 
191 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  34.45 
 
 
159 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.3 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  29.73 
 
 
173 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1411  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.87 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1730  Redoxin domain-containing protein  29.91 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.686612  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.72 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 
183 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  36.75 
 
 
182 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  34.31 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  31.79 
 
 
173 aa  67  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.64 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  32.84 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.27 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  27.12 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  33.58 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.5 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2837  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  31.43 
 
 
206 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0709911  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  27.2 
 
 
173 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  25.49 
 
 
160 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_004310  BR0098  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  31.97 
 
 
203 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  35.4 
 
 
164 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  33.05 
 
 
183 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0096  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  31.97 
 
 
203 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>