More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3382 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
202 aa  394  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  55.47 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  43.18 
 
 
191 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.76 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  39.72 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  40.91 
 
 
228 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  43.75 
 
 
223 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  36.96 
 
 
176 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  40 
 
 
223 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  34.29 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  39.26 
 
 
222 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.29 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  35.97 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  39.29 
 
 
220 aa  98.6  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.26 
 
 
183 aa  98.2  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  39.72 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  38.52 
 
 
170 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.85 
 
 
169 aa  95.9  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  34.29 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.85 
 
 
169 aa  95.9  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  37.97 
 
 
224 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.69 
 
 
183 aa  95.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  34.62 
 
 
195 aa  94.7  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  38.99 
 
 
223 aa  95.1  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  33.57 
 
 
196 aa  94.7  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  35.71 
 
 
238 aa  94  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  35.71 
 
 
238 aa  94  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  33.09 
 
 
193 aa  94  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  41.04 
 
 
209 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  34.43 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  34.43 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  37.04 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  33.61 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  33.61 
 
 
193 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  40 
 
 
229 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  34.29 
 
 
238 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  33.57 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  35.17 
 
 
168 aa  92  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  36.3 
 
 
222 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  31.67 
 
 
184 aa  92  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  34.48 
 
 
220 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.51 
 
 
170 aa  91.7  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  32.14 
 
 
194 aa  91.7  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.43 
 
 
177 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  31.28 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.82 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.47 
 
 
198 aa  89.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.89 
 
 
194 aa  89  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  32.86 
 
 
194 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  37.59 
 
 
210 aa  89  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  33.13 
 
 
183 aa  88.2  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  34.48 
 
 
220 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  32.37 
 
 
179 aa  87.8  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  40.44 
 
 
217 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.54 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  32.43 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  37.14 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1400  Redoxin domain protein  38.35 
 
 
188 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.61 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.37 
 
 
446 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.97 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  34.65 
 
 
170 aa  86.3  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  31.97 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.43 
 
 
194 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
192 aa  85.1  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  31.54 
 
 
195 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  32.5 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  34.43 
 
 
225 aa  84.7  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  33.1 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  30.77 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  34.71 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  33.61 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  37.18 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  33.33 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  31.91 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  37.68 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  27.5 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  39.55 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  30.71 
 
 
191 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  30.71 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  30.71 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  30.71 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.41 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  32.37 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  30.71 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  30.71 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  37.8 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  31.46 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.14 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  29.5 
 
 
232 aa  78.2  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  26.35 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.17 
 
 
166 aa  77.4  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  35.56 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  37.17 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  35 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  31.62 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  35.94 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  33.88 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>