More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0251 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  100 
 
 
193 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  62.22 
 
 
192 aa  236  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  62.92 
 
 
193 aa  233  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.16 
 
 
198 aa  229  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  60.77 
 
 
194 aa  229  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.36 
 
 
191 aa  229  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  61.24 
 
 
193 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  61.24 
 
 
193 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  57.81 
 
 
195 aa  227  8e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  61.76 
 
 
195 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  61.18 
 
 
195 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  64.02 
 
 
195 aa  220  8e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.86 
 
 
195 aa  218  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  58.86 
 
 
195 aa  218  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  54.44 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.32 
 
 
194 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.96 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  39.86 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  35.71 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  40.56 
 
 
194 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  39.86 
 
 
194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  39.16 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  38.46 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.57 
 
 
177 aa  121  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.14 
 
 
194 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  34.81 
 
 
211 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.12 
 
 
169 aa  104  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  39.52 
 
 
170 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  36.92 
 
 
176 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  38.02 
 
 
223 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  38.1 
 
 
168 aa  99.4  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.7 
 
 
170 aa  99.4  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.61 
 
 
169 aa  98.2  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  35.25 
 
 
223 aa  97.8  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  33.58 
 
 
171 aa  97.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.09 
 
 
202 aa  94  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.48 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  29.93 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  33.82 
 
 
228 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  26.24 
 
 
191 aa  92.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  32.41 
 
 
223 aa  92  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  29.14 
 
 
226 aa  91.7  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  28.89 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  31.25 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  29.45 
 
 
238 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  31.76 
 
 
170 aa  89.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  29.86 
 
 
220 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.82 
 
 
200 aa  89  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  34.23 
 
 
210 aa  88.6  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  32.17 
 
 
222 aa  87.8  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  29.66 
 
 
238 aa  87  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  29.66 
 
 
238 aa  87.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  31.62 
 
 
161 aa  87.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  33.11 
 
 
224 aa  85.9  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  31.85 
 
 
223 aa  85.5  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  32.14 
 
 
224 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  28.47 
 
 
193 aa  85.1  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  31.06 
 
 
437 aa  84.3  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  30.28 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  34.96 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3292  Redoxin domain protein  36.94 
 
 
453 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000783621  hitchhiker  0.000211392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  25.9 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.54 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  29.05 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.34 
 
 
168 aa  82  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  35.4 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  26.16 
 
 
221 aa  81.3  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  28.85 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  32.06 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  29.37 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  27.81 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  30.4 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  30.3 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  28.78 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.16 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
446 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  29.3 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0388  redoxin domain-containing protein  30.82 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  31.79 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.81 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1155  redoxin  32.06 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  32 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1400  Redoxin domain protein  33.58 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  25.53 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  27.08 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  33.33 
 
 
433 aa  75.1  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  28.99 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  35.19 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  28.79 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.51 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  25.93 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  32 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  25.74 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  30.77 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  25.35 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  26.32 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5620  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.05 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  32.69 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  33.04 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>