More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3288 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
213 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  98.59 
 
 
213 aa  411  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  87.26 
 
 
216 aa  329  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  64.74 
 
 
213 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  63.12 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  64.38 
 
 
217 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  49.25 
 
 
225 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  46.27 
 
 
224 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  45.27 
 
 
223 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  44.98 
 
 
221 aa  174  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  47.85 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  45.71 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  45.77 
 
 
220 aa  171  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  44.51 
 
 
229 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  42.93 
 
 
222 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  41.46 
 
 
222 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  43.53 
 
 
210 aa  161  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  44 
 
 
223 aa  161  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  43.89 
 
 
220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  42.78 
 
 
220 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  44.12 
 
 
228 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  42.86 
 
 
238 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  42.86 
 
 
238 aa  148  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  40.95 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.32 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  43.18 
 
 
191 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  44.22 
 
 
161 aa  122  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  29.72 
 
 
232 aa  112  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  42.86 
 
 
223 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  34.38 
 
 
195 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  39.86 
 
 
170 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  36.02 
 
 
187 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.77 
 
 
183 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  33.77 
 
 
183 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  40.69 
 
 
189 aa  101  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  33.13 
 
 
193 aa  101  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.97 
 
 
183 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.03 
 
 
198 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  33.73 
 
 
191 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  39.73 
 
 
182 aa  99.4  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  36.62 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.72 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  35.37 
 
 
209 aa  95.9  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  29.45 
 
 
193 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  29.45 
 
 
193 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.1 
 
 
169 aa  91.3  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.66 
 
 
169 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  28.08 
 
 
192 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  27.7 
 
 
195 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  28.08 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  34.72 
 
 
171 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  28.08 
 
 
193 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  27.7 
 
 
195 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  36.72 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
200 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  28.86 
 
 
195 aa  85.5  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
202 aa  85.1  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  32.39 
 
 
194 aa  84.7  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.52 
 
 
191 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.03 
 
 
195 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.03 
 
 
195 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  27.03 
 
 
195 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.11 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3536  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.16 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  30.56 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.1 
 
 
194 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  30.5 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  29.61 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  33.95 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  30.99 
 
 
194 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.84 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  30.99 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  30.77 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  32.94 
 
 
189 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.62 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.62 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  35.71 
 
 
168 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  33.16 
 
 
183 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.38 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.43 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  32 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  26.52 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  24.68 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  26.28 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.06 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  30.81 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  33.1 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0388  redoxin domain-containing protein  27.01 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  28.19 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28.71 
 
 
422 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1249  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.81 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.59 
 
 
188 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2065  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.21 
 
 
484 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.21 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  31.25 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.83 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  29.9 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  38.35 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>