More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2535 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
224 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  64.49 
 
 
220 aa  273  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  66.67 
 
 
220 aa  264  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  66.67 
 
 
220 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  55.05 
 
 
221 aa  247  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  55.56 
 
 
238 aa  240  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  53.78 
 
 
238 aa  225  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  53.78 
 
 
238 aa  225  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  52.07 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  50 
 
 
225 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  47.89 
 
 
226 aa  185  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  46.51 
 
 
223 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  48 
 
 
210 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  49.72 
 
 
229 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  49.51 
 
 
222 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  49.52 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  48.31 
 
 
222 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  53.21 
 
 
223 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  52.53 
 
 
217 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  49.21 
 
 
213 aa  164  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  49.46 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  39.38 
 
 
232 aa  162  6e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  50 
 
 
217 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  46.74 
 
 
213 aa  154  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.35 
 
 
203 aa  148  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  48.05 
 
 
216 aa  145  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  48.85 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  45.61 
 
 
223 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  38.76 
 
 
191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  36.65 
 
 
193 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  41.03 
 
 
161 aa  115  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  40.13 
 
 
184 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  43.65 
 
 
187 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  33.67 
 
 
195 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.97 
 
 
198 aa  99  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.67 
 
 
183 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
192 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.06 
 
 
183 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  35.06 
 
 
183 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
179 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  33.11 
 
 
195 aa  92.8  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  34.04 
 
 
194 aa  92  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.88 
 
 
191 aa  92  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
193 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
193 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.72 
 
 
195 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  30.72 
 
 
195 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.72 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  37.14 
 
 
182 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  36.64 
 
 
171 aa  89.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  33.93 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.06 
 
 
169 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  35.1 
 
 
176 aa  89.4  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  31.88 
 
 
193 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  30.07 
 
 
195 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.06 
 
 
169 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  32.14 
 
 
195 aa  86.3  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  33.11 
 
 
193 aa  85.9  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  31.87 
 
 
194 aa  85.1  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.72 
 
 
177 aa  85.1  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.86 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  33.33 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  37.4 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  36.96 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  37.4 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.97 
 
 
184 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.14 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.53 
 
 
200 aa  82  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  31.72 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  32.41 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.56 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.41 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  29.73 
 
 
168 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  36.96 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  40 
 
 
182 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
182 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  36 
 
 
269 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  38.19 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  36 
 
 
269 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.56 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  31.03 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0388  redoxin domain-containing protein  31.01 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017122 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  38.52 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  28.93 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  33.33 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  38.52 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  36.8 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  32.33 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.47 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.18 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  41.28 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  30.95 
 
 
170 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  29.92 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  37.78 
 
 
183 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1249  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.67 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0377  periplasmic thioredoxin (cytochrome c biogenesis)  28.97 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5968  Redoxin domain protein  35.2 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.566817  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  36.22 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  37.01 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2082  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.59 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>