More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7297 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  100 
 
 
217 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  86.18 
 
 
217 aa  308  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  61.5 
 
 
213 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  64.53 
 
 
213 aa  218  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  64.53 
 
 
213 aa  218  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  61.7 
 
 
216 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  56.14 
 
 
210 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  51.76 
 
 
224 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  47.89 
 
 
226 aa  191  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  46.89 
 
 
223 aa  191  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  48.89 
 
 
222 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  50.5 
 
 
225 aa  187  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  50.56 
 
 
229 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  48.31 
 
 
222 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  48.88 
 
 
228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  46.99 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  45.71 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  44.39 
 
 
220 aa  167  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  45.36 
 
 
238 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  45.36 
 
 
238 aa  164  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  46.41 
 
 
221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  43.86 
 
 
220 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  47.1 
 
 
238 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  44.44 
 
 
220 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.75 
 
 
203 aa  141  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  48.87 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  47.89 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  41.97 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  32.96 
 
 
232 aa  124  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  44.06 
 
 
223 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  35.42 
 
 
187 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  34.93 
 
 
195 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  36.59 
 
 
209 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.7 
 
 
184 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.56 
 
 
183 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  36.56 
 
 
183 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.36 
 
 
183 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  38.1 
 
 
182 aa  99  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  31.87 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  34.72 
 
 
176 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.61 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  32.39 
 
 
183 aa  92  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  30.81 
 
 
171 aa  92  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  40.44 
 
 
189 aa  91.3  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  27.27 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  32.64 
 
 
168 aa  88.6  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  26.25 
 
 
193 aa  88.6  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  26.25 
 
 
193 aa  88.6  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.15 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  23.6 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  31.13 
 
 
170 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  25.62 
 
 
193 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  34.59 
 
 
183 aa  85.1  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  33.1 
 
 
422 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  24.53 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.84 
 
 
195 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  25.32 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  38.36 
 
 
223 aa  82  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.04 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  26.45 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.17 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.33 
 
 
177 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.78 
 
 
191 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  31.37 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  24.66 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.66 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  34.78 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  29.85 
 
 
194 aa  79  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  32.39 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.06 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.29 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  26.02 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.78 
 
 
169 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  25.93 
 
 
179 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.19 
 
 
184 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1249  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.66 
 
 
331 aa  77  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.65 
 
 
168 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.63 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  31.88 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02625  hypothetical protein  30.51 
 
 
466 aa  76.3  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3292  Redoxin domain protein  31.15 
 
 
453 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000783621  hitchhiker  0.000211392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.11 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  34 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.85 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1889  thioredoxin family protein  32 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0172229 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.82 
 
 
445 aa  75.1  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  38.46 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  32.58 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  34.93 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.47 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  29.1 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  30.72 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  28.36 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  30.72 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  25.52 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  31.65 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  31.65 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  24.83 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>