More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3857 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  100 
 
 
220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  93.18 
 
 
220 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  66.67 
 
 
224 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  59.72 
 
 
220 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  53.3 
 
 
221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  51.85 
 
 
238 aa  220  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  51.85 
 
 
238 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  51.85 
 
 
238 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  48.81 
 
 
226 aa  181  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  46.23 
 
 
225 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  45.67 
 
 
224 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  46.41 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  42.34 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  49.1 
 
 
229 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  42.15 
 
 
222 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  44.38 
 
 
210 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  46.33 
 
 
223 aa  165  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  41.26 
 
 
228 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  48.08 
 
 
217 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.95 
 
 
232 aa  157  9e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  43.41 
 
 
213 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  45.57 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  43.89 
 
 
213 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  43.89 
 
 
213 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  40.62 
 
 
216 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  42.38 
 
 
161 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  38.71 
 
 
195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  41.67 
 
 
191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  36.2 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  35.37 
 
 
187 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  33.33 
 
 
191 aa  104  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  35.22 
 
 
184 aa  104  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  39.6 
 
 
223 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.64 
 
 
191 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.42 
 
 
183 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.76 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  32.86 
 
 
193 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  32.86 
 
 
193 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  35.76 
 
 
183 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.76 
 
 
198 aa  95.9  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  32.04 
 
 
209 aa  95.5  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  31.69 
 
 
195 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  32.14 
 
 
195 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.14 
 
 
195 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  32.12 
 
 
193 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.14 
 
 
195 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  32.14 
 
 
195 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  32.86 
 
 
194 aa  92  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  31.25 
 
 
193 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  32.59 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.86 
 
 
200 aa  89  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.48 
 
 
202 aa  88.2  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  29.29 
 
 
192 aa  88.2  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  34.19 
 
 
176 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  35.86 
 
 
171 aa  85.9  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  36.09 
 
 
183 aa  85.5  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  35.66 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  26.95 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
169 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.43 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  31.94 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.17 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.94 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  36.15 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  36.03 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0388  redoxin domain-containing protein  29.44 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017122 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.58 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  30.15 
 
 
168 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  30.34 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  28.67 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  37.12 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  29.86 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  36.92 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  30.92 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.4 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  38.6 
 
 
170 aa  74.7  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  35.94 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02625  hypothetical protein  34.92 
 
 
466 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  37.01 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  38.14 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  37.88 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  37.88 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.78 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  35.94 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  42.68 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  34.4 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  33.87 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  38.6 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.38 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  33.09 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
194 aa  72  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
194 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
194 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.06 
 
 
199 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.75 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  35.16 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>