More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4281 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
192 aa  388  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  74.07 
 
 
191 aa  296  9e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  70.88 
 
 
198 aa  273  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  73.78 
 
 
195 aa  269  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  69.83 
 
 
193 aa  261  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  63.87 
 
 
195 aa  261  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  66.13 
 
 
194 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  69.41 
 
 
195 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  68.16 
 
 
193 aa  255  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  68.16 
 
 
193 aa  255  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  69.41 
 
 
195 aa  254  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.82 
 
 
195 aa  252  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  68.82 
 
 
195 aa  252  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  62.22 
 
 
193 aa  236  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  55.03 
 
 
179 aa  214  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  40.74 
 
 
196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
194 aa  131  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  40 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  39.26 
 
 
194 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  38.52 
 
 
194 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.52 
 
 
194 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.04 
 
 
177 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.78 
 
 
194 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  37.78 
 
 
194 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.04 
 
 
194 aa  121  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
211 aa  114  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  33.56 
 
 
170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  30.21 
 
 
223 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  28.31 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  29.47 
 
 
210 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  31.65 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
224 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  28.82 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  30.6 
 
 
161 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  34.45 
 
 
223 aa  95.9  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.58 
 
 
203 aa  94.7  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  32.81 
 
 
176 aa  94  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  29.35 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  29.45 
 
 
238 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  31.85 
 
 
223 aa  92  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  28.17 
 
 
191 aa  92  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  38.26 
 
 
168 aa  91.7  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 
170 aa  91.3  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.83 
 
 
169 aa  90.9  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.85 
 
 
169 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.07 
 
 
288 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  27.07 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  33.93 
 
 
171 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  30.43 
 
 
228 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  28.37 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  31.85 
 
 
238 aa  87.8  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  31.85 
 
 
238 aa  87.8  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  29.29 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  27.22 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  28.47 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  29.75 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  27.86 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  24.84 
 
 
217 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  30.43 
 
 
224 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.22 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  30.3 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  32.39 
 
 
220 aa  85.1  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  29.29 
 
 
222 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  25.23 
 
 
222 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  29.37 
 
 
220 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  25.51 
 
 
193 aa  84.7  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  26.88 
 
 
232 aa  84.7  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28.8 
 
 
422 aa  84.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  26.23 
 
 
225 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  31.75 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  29.08 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.92 
 
 
409 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.7 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0388  redoxin domain-containing protein  31.47 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017122 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  30.83 
 
 
437 aa  81.3  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  29.77 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  25.41 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.4 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.85 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  25.71 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  31.06 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  32.52 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  29.85 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.5 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  35.48 
 
 
403 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  29.01 
 
 
181 aa  79  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  25.17 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  24.16 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  27.7 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  35.48 
 
 
403 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2982  hypothetical protein  30.28 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.0639379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  30 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6578  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.28 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.861573 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1823  redoxin domain-containing protein  28.68 
 
 
155 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2154  redoxin domain-containing protein  28.68 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00992138  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  23.48 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.36 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5620  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.53 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  33.01 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>