More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3502 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  54.3 
 
 
191 aa  167  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.86 
 
 
203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  45.22 
 
 
161 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  41.36 
 
 
223 aa  124  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  41.06 
 
 
223 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  44.22 
 
 
226 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 
183 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  43.71 
 
 
210 aa  121  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  41.1 
 
 
183 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  45.61 
 
 
224 aa  121  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  45.58 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  41.26 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  38.65 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 
183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  43.7 
 
 
176 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  43.45 
 
 
228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  40.94 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  42.38 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  46.38 
 
 
223 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  45.71 
 
 
220 aa  114  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  39.44 
 
 
238 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  39.44 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  43.24 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.26 
 
 
169 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.26 
 
 
169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  38.89 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  45.04 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  38.67 
 
 
222 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  40.94 
 
 
168 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  41.61 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  39.52 
 
 
171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  44.27 
 
 
213 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  36.91 
 
 
184 aa  108  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  45.38 
 
 
217 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  44.06 
 
 
217 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  36.73 
 
 
187 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.75 
 
 
202 aa  105  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  39.72 
 
 
221 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.71 
 
 
170 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  36.72 
 
 
170 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  39.85 
 
 
195 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  42.75 
 
 
193 aa  102  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  40.41 
 
 
220 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  31.93 
 
 
193 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  31.03 
 
 
194 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  35.42 
 
 
220 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.65 
 
 
195 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  38.57 
 
 
182 aa  99.8  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  30.32 
 
 
195 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  31.33 
 
 
193 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  31.33 
 
 
193 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  29.65 
 
 
195 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.86 
 
 
198 aa  98.6  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  35.25 
 
 
193 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  29.07 
 
 
195 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.07 
 
 
195 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  28.82 
 
 
192 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.81 
 
 
200 aa  95.5  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  31.37 
 
 
195 aa  95.9  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  30.4 
 
 
179 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  38.52 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  34.66 
 
 
209 aa  92.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  35.25 
 
 
170 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  35.97 
 
 
422 aa  89.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  38.06 
 
 
133 aa  88.6  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  37.1 
 
 
170 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.91 
 
 
191 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.08 
 
 
177 aa  85.5  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  37.3 
 
 
173 aa  85.1  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  42.86 
 
 
189 aa  85.1  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  36.64 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.91 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  31.91 
 
 
183 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0388  redoxin domain-containing protein  35.46 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017122 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  30.63 
 
 
170 aa  82  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  34.85 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  30.77 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  36.22 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  36.22 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  37.01 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  30.5 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  33.73 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  35.43 
 
 
278 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  33.09 
 
 
168 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.6 
 
 
166 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  30.26 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.43 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.22 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  33.33 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.22 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.82 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.25 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0948  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.72 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  31.21 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.83 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  32.12 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  30.26 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  32.09 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>