More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3488 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  100 
 
 
216 aa  424  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  87.74 
 
 
213 aa  332  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  92.97 
 
 
213 aa  328  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  65.78 
 
 
213 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  62.26 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  63.74 
 
 
217 aa  197  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  51.72 
 
 
225 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  43.38 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  46 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  46.86 
 
 
226 aa  171  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  45.77 
 
 
220 aa  165  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  45.45 
 
 
229 aa  164  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  43.93 
 
 
210 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  44.44 
 
 
221 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  42.47 
 
 
222 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  47.57 
 
 
224 aa  158  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  43.68 
 
 
223 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  40.86 
 
 
222 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  45.29 
 
 
228 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  41.76 
 
 
220 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  40.66 
 
 
220 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  46.55 
 
 
238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  46.55 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  43.93 
 
 
238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.65 
 
 
203 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  41.35 
 
 
191 aa  118  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  42.28 
 
 
161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  29.67 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  41.61 
 
 
223 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  33.51 
 
 
195 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.42 
 
 
183 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  34.97 
 
 
191 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  34.42 
 
 
183 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  32.07 
 
 
193 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  40.69 
 
 
189 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.97 
 
 
183 aa  98.2  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  36.6 
 
 
170 aa  98.2  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  33.97 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.46 
 
 
198 aa  95.1  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  37.8 
 
 
182 aa  94.4  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  35.42 
 
 
176 aa  92  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  34.38 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.16 
 
 
184 aa  89  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  28.28 
 
 
192 aa  88.2  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  27.74 
 
 
195 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  34.93 
 
 
171 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  28.48 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.41 
 
 
169 aa  85.9  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  28.48 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  28.48 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.97 
 
 
194 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
169 aa  85.5  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  27.63 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.69 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.88 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.97 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.97 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  35.9 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.11 
 
 
194 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  32.67 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.58 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  24.58 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.9 
 
 
191 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  26.49 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.41 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3536  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.6 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.9 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.67 
 
 
184 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  32 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  32.06 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  32.31 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  35.71 
 
 
168 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.85 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  32.82 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  32.06 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  31.46 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.59 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  25.52 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  31.96 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  35.21 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  30.14 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  30 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  31.25 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  27.66 
 
 
170 aa  74.7  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.32 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  25.74 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  29.08 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  31.01 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.35 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.59 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0388  redoxin domain-containing protein  27.91 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  31.01 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  24.63 
 
 
179 aa  72  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2065  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.95 
 
 
484 aa  72.4  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  30.77 
 
 
188 aa  72  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.08 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1249  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.97 
 
 
331 aa  71.6  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  34.06 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>