More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0200 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  41.11 
 
 
183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  46.53 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  42.14 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  40.69 
 
 
216 aa  100  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  41.98 
 
 
213 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  41.98 
 
 
213 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  41.91 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.98 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  41.98 
 
 
183 aa  95.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  42.65 
 
 
213 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.46 
 
 
183 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  38.81 
 
 
161 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.22 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  39.07 
 
 
209 aa  90.9  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  37.5 
 
 
225 aa  89.4  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  40.46 
 
 
217 aa  89  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.54 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  40.98 
 
 
223 aa  88.2  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  38.85 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  39.72 
 
 
195 aa  85.9  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  42.86 
 
 
223 aa  85.1  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  40 
 
 
229 aa  85.1  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  33.61 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  37.14 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  34.35 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.78 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  37.4 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  36.64 
 
 
238 aa  82  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  31.01 
 
 
223 aa  80.9  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  36.36 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  38.52 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  36.3 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  36.03 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  29.19 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  29.19 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.38 
 
 
198 aa  79  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  36.36 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  35.43 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  37.1 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  34.35 
 
 
238 aa  77.8  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  34.35 
 
 
238 aa  77.8  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  34.59 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
270 aa  77  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  36.3 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  34.85 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  34.15 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  35.56 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  30.15 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  28.89 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  28.11 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.16 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  32.59 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  30.16 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.16 
 
 
195 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  31.06 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  39.32 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  33.58 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  30.16 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  27.56 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.86 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  30.28 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
269 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  27.64 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.01 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  29.71 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.88 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  42.48 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  34.82 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  31.97 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  28.79 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  36.54 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.21 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.21 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  36.54 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1378  Redoxin domain protein  38.57 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.677919  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.87 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  34.13 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  36.54 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  33.83 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  36.13 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.82 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  30.41 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4485  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.25 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000697653 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  32.62 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.97 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  32.8 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.92 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  32.8 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.24 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  30.9 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  36.15 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  33.33 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.44 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  36.04 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  29.66 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  30.15 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>