More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2678 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  43.58 
 
 
170 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  40.56 
 
 
189 aa  147  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  44.03 
 
 
223 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  35.51 
 
 
191 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  35.46 
 
 
196 aa  96.3  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.57 
 
 
194 aa  94.7  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.97 
 
 
200 aa  93.6  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  38.52 
 
 
268 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.57 
 
 
194 aa  90.9  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  40.32 
 
 
161 aa  90.5  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  37.23 
 
 
170 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  33.16 
 
 
222 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  29.19 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  29.03 
 
 
195 aa  89.4  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  29.19 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.13 
 
 
202 aa  88.2  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  33.57 
 
 
194 aa  88.6  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.62 
 
 
169 aa  88.2  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  27.88 
 
 
194 aa  87.8  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.87 
 
 
194 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.96 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  28.11 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.77 
 
 
177 aa  85.9  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  32.87 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  31.82 
 
 
195 aa  85.5  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  32.17 
 
 
194 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  34.18 
 
 
223 aa  84.7  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  34.59 
 
 
217 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.56 
 
 
203 aa  84.3  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  35.86 
 
 
290 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
209 aa  84.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  35.42 
 
 
168 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4485  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.73 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000697653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  31.91 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  34.46 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  32.17 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  37.4 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  32.09 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  35.77 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  36.43 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.62 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.04 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  32.87 
 
 
194 aa  82  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  31.06 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  34.38 
 
 
211 aa  82  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  34.04 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  36.43 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  37.4 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  37.4 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  26.67 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  29.77 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.54 
 
 
194 aa  80.9  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  37.4 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  33.53 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  36.76 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  31.13 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  26.06 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  34.73 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  34.78 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  34.73 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  34.73 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  34.73 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  36.59 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  32.57 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  35 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.06 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  33.09 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  34.73 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  33.6 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  28.66 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  32.56 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  32.03 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  32.3 
 
 
195 aa  79  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  32.56 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.06 
 
 
288 aa  78.2  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.53 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  29.09 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  29.09 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  35.86 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  29.09 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  32.17 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  31.61 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  31.85 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  33.53 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  29.93 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  28.25 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  30.18 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  38.28 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  30.18 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.41 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  34.4 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.3 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  32.93 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  34.75 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  34.17 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.22 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0836  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.4 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  unclonable  0.000000000312074 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.94 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>