More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3774 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 
173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  47.37 
 
 
170 aa  166  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  35.77 
 
 
191 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  31.65 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
170 aa  90.5  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.37 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  29.19 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  31.34 
 
 
168 aa  88.2  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  35.11 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  38.06 
 
 
238 aa  88.2  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  34.71 
 
 
176 aa  88.2  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.94 
 
 
183 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  29.93 
 
 
193 aa  87.8  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  31.01 
 
 
195 aa  87.8  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
169 aa  87.4  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  29.08 
 
 
195 aa  87.4  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.08 
 
 
195 aa  87.4  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.93 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  39.26 
 
 
223 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.3 
 
 
169 aa  87  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  29.93 
 
 
195 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  29.2 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  29.82 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  29.71 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  28.12 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  28.12 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  35.46 
 
 
222 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  37.3 
 
 
223 aa  85.5  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  40.77 
 
 
220 aa  85.9  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  29.2 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  29.2 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  30.3 
 
 
192 aa  85.5  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  31.15 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.13 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.15 
 
 
194 aa  84.7  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  31.25 
 
 
194 aa  84.7  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  27.5 
 
 
173 aa  84.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  34.04 
 
 
223 aa  84.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  41.67 
 
 
203 aa  84.3  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.95 
 
 
171 aa  84.3  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  29.61 
 
 
173 aa  84.3  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  35.29 
 
 
238 aa  84.3  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  36.36 
 
 
182 aa  84.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.06 
 
 
183 aa  84.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.91 
 
 
191 aa  84  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.19 
 
 
203 aa  84  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  35.29 
 
 
238 aa  84  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4318  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.39 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.077918 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  26.09 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2106  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.5 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  27.34 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  30.33 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  34.31 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  31.75 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  34.51 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  31.11 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  36.15 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  28.78 
 
 
174 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  36.03 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  33.61 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  26.09 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  26.09 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  36.27 
 
 
160 aa  82  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  27.04 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  30.95 
 
 
194 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4758  redoxin domain-containing protein  36.52 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366616  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  26.88 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  26.09 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.77 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.78 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  33.64 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  34.31 
 
 
222 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  33.58 
 
 
195 aa  80.9  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.83 
 
 
422 aa  80.9  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  30.36 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  28.85 
 
 
193 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  33.57 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  31.68 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  32.89 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  35.2 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  33.6 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  34.82 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  28.47 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1448  thioredoxin family protein  31.34 
 
 
390 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00492149  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.06 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  25.62 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
184 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  28.12 
 
 
195 aa  79  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  31.75 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  26.25 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0341  redoxin domain-containing protein  36.43 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  31.25 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  36.96 
 
 
224 aa  77.4  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  33.33 
 
 
232 aa  77.4  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  33.33 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  33.33 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.78 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  33.33 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  33.33 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>