More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1730 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1730  Redoxin domain-containing protein  100 
 
 
200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.686612  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  38.93 
 
 
164 aa  97.8  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  35.61 
 
 
278 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  35.61 
 
 
278 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2593  putative thiol:disulfide interchange protein  35.29 
 
 
276 aa  89.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357458  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  35.46 
 
 
278 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  35.61 
 
 
278 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  35.61 
 
 
269 aa  88.2  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  35.61 
 
 
278 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1703  redoxin domain-containing protein  29.76 
 
 
273 aa  84.3  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  35.11 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  35.11 
 
 
169 aa  82  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  32.43 
 
 
269 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  32.05 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2252  putative thiol:disulfide interchange protein  31.9 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  33.88 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  36.36 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  38.05 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  31.94 
 
 
269 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  30.52 
 
 
279 aa  79  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  32.54 
 
 
194 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  31.75 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  31.94 
 
 
269 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  30.95 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  30.95 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  31.5 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3733  redoxin domain-containing protein  34.34 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919007  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  27.61 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  31.19 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1412  Redoxin domain protein  31.72 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2433  redoxin domain-containing protein  31.72 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  32.37 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.71 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  32.37 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  32.37 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  32.37 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  30.28 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.33 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  30.28 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  32.37 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  30.28 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  32.37 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  32.37 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  30.65 
 
 
278 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  30.65 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  34.04 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.94 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  27.41 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  27.41 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  27.41 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  27.21 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  27.41 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  32.5 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  25.93 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  30.94 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2109  redoxin  28.26 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  30.94 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2788  putative thiol:disulfide interchange protein  32.06 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  33.04 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.93 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.93 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  25.93 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  29.91 
 
 
278 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  26.67 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.85 
 
 
445 aa  66.2  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3246  redoxin domain-containing protein  29.46 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.5 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  28.35 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  25.93 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  29.2 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2634  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.43 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.17 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.28 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.09 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  32.82 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  23.74 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  30.72 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  27.15 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  25.71 
 
 
201 aa  62  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  29.17 
 
 
195 aa  61.6  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  28.37 
 
 
184 aa  61.6  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.72 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1391  periplasmic protein thiol  29.66 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.63 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.15 
 
 
355 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  27.54 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.93 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  30.77 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  28.03 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1108  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.49 
 
 
189 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.63 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  29.63 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  29.92 
 
 
211 aa  58.9  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  27.78 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  27.78 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  27.78 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>