More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2252 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2252  putative thiol:disulfide interchange protein  100 
 
 
271 aa  531  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  64.15 
 
 
269 aa  322  5e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  49.06 
 
 
279 aa  248  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  51.87 
 
 
278 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  44.36 
 
 
278 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  44.36 
 
 
278 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  43.82 
 
 
278 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  44.61 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  42.12 
 
 
278 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  43.23 
 
 
278 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  51.4 
 
 
268 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  47.22 
 
 
279 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1703  redoxin domain-containing protein  42.54 
 
 
273 aa  201  9e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2593  putative thiol:disulfide interchange protein  46.53 
 
 
276 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2109  redoxin  37.59 
 
 
271 aa  192  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  44.44 
 
 
278 aa  188  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  49.51 
 
 
278 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  49.51 
 
 
278 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  45.08 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  43.33 
 
 
270 aa  178  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2788  putative thiol:disulfide interchange protein  54.55 
 
 
195 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  43.84 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2433  redoxin domain-containing protein  42.5 
 
 
277 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  38.01 
 
 
277 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1412  Redoxin domain protein  45.61 
 
 
263 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  44.34 
 
 
269 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  44.34 
 
 
269 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  43.19 
 
 
269 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  42.72 
 
 
269 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  42.72 
 
 
269 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  42.72 
 
 
269 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  40.93 
 
 
332 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3246  redoxin domain-containing protein  35.78 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3733  redoxin domain-containing protein  35.43 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919007  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  40.15 
 
 
164 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  41.67 
 
 
169 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2634  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.55 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1730  Redoxin domain-containing protein  31.9 
 
 
200 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.686612  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1492  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.58 
 
 
193 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  30.06 
 
 
173 aa  82  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  30.06 
 
 
173 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  30.06 
 
 
173 aa  82  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  32.61 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  30.06 
 
 
173 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  30.06 
 
 
173 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  29.45 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  29.45 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  30.85 
 
 
209 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.82 
 
 
189 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1872  heat shock protein DnaJ-like  30.08 
 
 
180 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.506662  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  28.83 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  37.4 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  35.14 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.03 
 
 
199 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.58 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  27.61 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.32 
 
 
166 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  36.92 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  36.92 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.04 
 
 
183 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  27.61 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  38.66 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  36.15 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  36.15 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  37.21 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  30.15 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  30.32 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  30.15 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  30.15 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  30.15 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  30.15 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  31.75 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  35.38 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  30.88 
 
 
191 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  37.3 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.17 
 
 
184 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  35.38 
 
 
184 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  32.88 
 
 
161 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  30.15 
 
 
191 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  26.99 
 
 
173 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  30.94 
 
 
165 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  31.75 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3658  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  32.62 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1408  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  31.45 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  30.15 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  33.58 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.93 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  30.95 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.99 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.86 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1412  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  28.36 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.49361  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0470  putative thiol:disulfide interchange protein  32.52 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  33.59 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.43 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0679  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.21 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.37 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  30.95 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.68 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  34.75 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>