More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0269 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0269  Redoxin domain-containing protein  100 
 
 
188 aa  377  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.890492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  67.24 
 
 
189 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  50 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  48.26 
 
 
205 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  47.31 
 
 
248 aa  164  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3091  Redoxin domain protein  41.86 
 
 
203 aa  140  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0827  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.7 
 
 
179 aa  138  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  42.78 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  41.67 
 
 
203 aa  132  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  43.21 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  45.1 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4433  redoxin domain-containing protein  39.06 
 
 
208 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  38.8 
 
 
203 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  38.8 
 
 
203 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  38.8 
 
 
203 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  44.38 
 
 
213 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  51.69 
 
 
237 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0501  redoxin domain-containing protein  41.48 
 
 
200 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0628  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.88 
 
 
206 aa  118  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603467  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  36.84 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0521  Redoxin domain protein  36.93 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000754545  hitchhiker  0.00309639 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0926  Redoxin domain protein  40.45 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10537  thioredoxin  37.06 
 
 
216 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.154005  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4098  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.02 
 
 
191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  36.05 
 
 
180 aa  111  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  41.84 
 
 
209 aa  111  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  45.14 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07200  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  38.65 
 
 
181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2734  Redoxin domain protein  40.41 
 
 
204 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627049  normal  0.0544448 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0689  Redoxin domain protein  36.71 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0960762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.29 
 
 
195 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.67 
 
 
191 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000658769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3254  Redoxin domain protein  38.36 
 
 
198 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0648017  normal  0.303521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0444  Redoxin domain protein  36.94 
 
 
176 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.567513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.65 
 
 
201 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4484  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.55 
 
 
195 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0692  redoxin  33.87 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0685  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.87 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0705  redoxin domain-containing protein  33.87 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.12 
 
 
200 aa  99  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3240  redoxin domain-containing protein  33.71 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  34.46 
 
 
188 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24350  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  37.11 
 
 
203 aa  95.9  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0052  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.56 
 
 
200 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5347  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.8 
 
 
223 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3710  redoxin domain-containing protein  32.8 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
240 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5664  redoxin domain-containing protein  32.8 
 
 
223 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.76 
 
 
240 aa  92  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0866  redoxin domain-containing protein  35 
 
 
200 aa  92  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141982  normal  0.0297264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02940  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  39.31 
 
 
183 aa  87.8  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0986235  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2673  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.08 
 
 
204 aa  85.5  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2624  Redoxin domain protein  34.74 
 
 
204 aa  85.1  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1036  Redoxin domain protein  33.96 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  35.21 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  36.8 
 
 
175 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  38.21 
 
 
184 aa  79  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.26 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  33.33 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  34.51 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  27.37 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  34.59 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.86 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  35.46 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.68 
 
 
228 aa  74.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  34.51 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  35.16 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  31.54 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  30.84 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  28.03 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  34.71 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  28.03 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.25 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  34.51 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  33.8 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  33.8 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  36.54 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0417  thiol:disulfide interchange protein DsbE  35.88 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  32.26 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  36.89 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.23 
 
 
422 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4771  periplasmic protein thiol:disulfide oxidoreductase DsbE  38.74 
 
 
179 aa  72  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  36.11 
 
 
202 aa  72  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.58 
 
 
166 aa  72  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  32.88 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  32.56 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1872  heat shock protein DnaJ-like  34.96 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.506662  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1003  periplasmic protein thiol  34.19 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0767014  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0463  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  36.75 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  29.75 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.43 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  35.16 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  33.8 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.37 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  29.44 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.93 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1412  Redoxin domain protein  33.54 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  34.26 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.79 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2433  redoxin domain-containing protein  33.54 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>