More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2673 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2673  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
204 aa  410  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2624  Redoxin domain protein  98.53 
 
 
204 aa  407  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1036  Redoxin domain protein  61.4 
 
 
196 aa  216  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4484  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.95 
 
 
195 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  58.86 
 
 
188 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3240  redoxin domain-containing protein  58.52 
 
 
198 aa  211  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  61.11 
 
 
240 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5664  redoxin domain-containing protein  60.67 
 
 
223 aa  208  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5347  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  60.67 
 
 
223 aa  208  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  60.84 
 
 
200 aa  207  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3710  redoxin domain-containing protein  60.11 
 
 
218 aa  206  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0052  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.89 
 
 
200 aa  204  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0866  redoxin domain-containing protein  59.89 
 
 
200 aa  204  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141982  normal  0.0297264 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.16 
 
 
240 aa  204  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10537  thioredoxin  54.08 
 
 
216 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.154005  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0685  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.61 
 
 
203 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0692  redoxin  55.61 
 
 
203 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0705  redoxin domain-containing protein  55.61 
 
 
203 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.85 
 
 
195 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0926  Redoxin domain protein  45.03 
 
 
199 aa  161  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0689  Redoxin domain protein  49.42 
 
 
188 aa  151  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0960762  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02940  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  46.07 
 
 
183 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0986235  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4098  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.58 
 
 
191 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  36.36 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.38 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000658769 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  36.87 
 
 
191 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  36.57 
 
 
205 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  34.54 
 
 
189 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  34.66 
 
 
248 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0827  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.26 
 
 
179 aa  98.2  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0444  Redoxin domain protein  37.71 
 
 
176 aa  98.2  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.567513  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0628  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.58 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603467  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  35.2 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  45.24 
 
 
194 aa  95.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3091  Redoxin domain protein  34.17 
 
 
203 aa  94  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  40.91 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  33.7 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0269  Redoxin domain-containing protein  37.58 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.890492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2734  Redoxin domain protein  39.47 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627049  normal  0.0544448 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  43.24 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  43.24 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  43.24 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0521  Redoxin domain protein  33.53 
 
 
206 aa  89  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000754545  hitchhiker  0.00309639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  35.75 
 
 
209 aa  89  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  35 
 
 
180 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  36.36 
 
 
209 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07200  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  42.02 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4433  redoxin domain-containing protein  34.29 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24350  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  34.64 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3254  Redoxin domain protein  38.58 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0648017  normal  0.303521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.11 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  30.77 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  32.38 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  35.56 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.62 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.87 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  32.5 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  31.15 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  32.28 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  34.43 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.93 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.65 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0501  redoxin domain-containing protein  35.53 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1928  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  28.21 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.652807  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  26.67 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.31 
 
 
168 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  28.68 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  31.25 
 
 
172 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2803  putative thioredoxin  37.61 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  28 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  34.43 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  29.53 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  35.04 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  26.95 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  35.85 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  28.29 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  26.71 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  26.71 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.27 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  26.95 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  33.88 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  34.19 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  35.04 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  35.04 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  35.04 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  35.04 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1313  Redoxin domain protein  28.8 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000515497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.53 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  30.43 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.43 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.62 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  26.17 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  29.76 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2801  thiol-disulfide interchange protein  37.89 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00941693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3536  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.73 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  25.53 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2000  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.68 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>