More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6244 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  74.04 
 
 
691 aa  922    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  62.22 
 
 
589 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  99.19 
 
 
619 aa  1204    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  60.81 
 
 
589 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  62.26 
 
 
592 aa  732    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  85.24 
 
 
626 aa  1022    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  92.63 
 
 
623 aa  1063    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.55 
 
 
609 aa  789    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  61.25 
 
 
591 aa  718    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  73.4 
 
 
622 aa  864    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  71.89 
 
 
596 aa  843    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  74.24 
 
 
604 aa  864    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 
619 aa  1212    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  57.8 
 
 
589 aa  639    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  90.95 
 
 
625 aa  1058    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 
619 aa  1212    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  90.91 
 
 
622 aa  1078    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  60.23 
 
 
598 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  56.45 
 
 
581 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.78 
 
 
596 aa  598  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  60.94 
 
 
435 aa  501  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  53.59 
 
 
466 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  53.81 
 
 
466 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  56.72 
 
 
469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50 
 
 
576 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.43 
 
 
404 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.3 
 
 
403 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  54.28 
 
 
381 aa  352  1e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.39 
 
 
570 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  31.67 
 
 
695 aa  259  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  29.63 
 
 
659 aa  209  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  61.38 
 
 
178 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  60 
 
 
184 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  59.31 
 
 
178 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  34.37 
 
 
369 aa  204  5e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  57.42 
 
 
188 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  57.93 
 
 
178 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  57.64 
 
 
189 aa  193  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  54.39 
 
 
187 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  59.44 
 
 
193 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.5 
 
 
200 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  55.26 
 
 
193 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  55.26 
 
 
193 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  55.26 
 
 
193 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  56.74 
 
 
197 aa  180  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  53.25 
 
 
186 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  56.03 
 
 
197 aa  177  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  58.02 
 
 
193 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  42.01 
 
 
249 aa  127  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  40.79 
 
 
581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.59 
 
 
493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  32.08 
 
 
503 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  42.86 
 
 
644 aa  107  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  35.26 
 
 
697 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  32.94 
 
 
504 aa  100  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.91 
 
 
688 aa  99  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  37.31 
 
 
699 aa  96.3  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.3 
 
 
612 aa  97.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.3 
 
 
612 aa  96.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  33.77 
 
 
498 aa  96.3  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  35.96 
 
 
672 aa  95.9  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.06 
 
 
639 aa  95.1  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.81 
 
 
612 aa  95.5  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.04 
 
 
628 aa  95.5  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  37.78 
 
 
674 aa  93.6  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  33.5 
 
 
487 aa  93.6  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  34.33 
 
 
634 aa  89.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  20.55 
 
 
403 aa  89.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  37.5 
 
 
584 aa  89  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  20.05 
 
 
403 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.94 
 
 
641 aa  82  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  24.11 
 
 
735 aa  77.4  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4168  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.25 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.71 
 
 
445 aa  76.6  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  34.97 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.14 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  30.73 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  28.57 
 
 
183 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  31.25 
 
 
168 aa  72  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30.83 
 
 
173 aa  71.6  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3286  cytochrome c biogenesis protein  38.46 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549106  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  31.85 
 
 
160 aa  69.7  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.19 
 
 
196 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  29.66 
 
 
167 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.2 
 
 
228 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  33.33 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  27.09 
 
 
472 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.39 
 
 
189 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  27.87 
 
 
172 aa  64.7  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  28.93 
 
 
203 aa  65.1  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.6 
 
 
183 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  30.08 
 
 
173 aa  64.7  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.94 
 
 
280 aa  64.7  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  28.48 
 
 
172 aa  64.3  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3524  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.54 
 
 
242 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239201  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.41 
 
 
403 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313576  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0334  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  29.95 
 
 
237 aa  63.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4600  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.54 
 
 
242 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.8 
 
 
223 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0634  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.6 
 
 
408 aa  62.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0779825  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>