More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0868 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  100 
 
 		 469 aa  927    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  57.54 
 
 		 625 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  57.26 
 
 		 622 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  55.6 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  56.87 
 
 		 623 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  56.53 
 
 		 626 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  55.36 
 
 		 619 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  55.36 
 
 		 619 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  53.04 
 
 		 591 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.5 
 
 		 609 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  55.92 
 
 		 604 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  53.28 
 
 		 592 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  55.68 
 
 		 622 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  55.67 
 
 		 596 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  54.27 
 
 		 589 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  53.13 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  48.92 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  49.03 
 
 		 466 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  54.14 
 
 		 598 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.2 
 
 		 596 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  51.34 
 
 		 589 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  52.18 
 
 		 589 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  44.79 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  44.79 
 
 		 403 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  45.51 
 
 		 581 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.72 
 
 		 576 aa  298  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  66.67 
 
 		 619 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  32.91 
 
 		 695 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.56 
 
 		 570 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  60 
 
 		 178 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  55.29 
 
 		 381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  58.62 
 
 		 178 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  55.63 
 
 		 184 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  56.67 
 
 		 188 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  56.55 
 
 		 178 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  54.19 
 
 		 189 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  51.74 
 
 		 187 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  53.21 
 
 		 186 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  33 
 
 		 659 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  53.85 
 
 		 193 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  52.67 
 
 		 193 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  52.67 
 
 		 193 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  53.9 
 
 		 197 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  52.67 
 
 		 193 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  53.9 
 
 		 197 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  56.25 
 
 		 193 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.24 
 
 		 200 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  44.38 
 
 		 369 aa  169  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  41.43 
 
 		 581 aa  124  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.1 
 
 		 493 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  39.1 
 
 		 503 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  42.75 
 
 		 249 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.01 
 
 		 628 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  41.04 
 
 		 697 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  40.91 
 
 		 644 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  41.79 
 
 		 674 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  41.67 
 
 		 672 aa  106  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.91 
 
 		 612 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.15 
 
 		 612 aa  104  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  37.31 
 
 		 634 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  43.22 
 
 		 699 aa  103  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  33.74 
 
 		 504 aa  103  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.3 
 
 		 612 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.81 
 
 		 639 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  35.92 
 
 		 498 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  37.41 
 
 		 487 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.31 
 
 		 641 aa  97.4  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.98 
 
 		 688 aa  97.1  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  36.75 
 
 		 584 aa  83.2  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  33.59 
 
 		 173 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  32.52 
 
 		 168 aa  80.9  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  18.91 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  38.51 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  34.85 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  34.85 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  30.77 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  31.03 
 
 		 167 aa  75.1  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  31.54 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  31.39 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  32.33 
 
 		 167 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  30.83 
 
 		 165 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.34 
 
 		 228 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  32.33 
 
 		 167 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3286  cytochrome c biogenesis protein  34.72 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.54 
 
 		 196 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0270  putative transmembrane protein  30.83 
 
 		 174 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  31.43 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  30.83 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.42 
 
 		 188 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1715  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  28.08 
 
 		 214 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0270352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.96 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.69 
 
 		 193 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  30.83 
 
 		 168 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.73 
 
 		 183 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  29.55 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  29.6 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  30.77 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0217  redoxin domain-containing protein  30.3 
 
 		 171 aa  67  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  28.23 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.571735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>