More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5143 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
197 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  98.48 
 
 
197 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  88.32 
 
 
193 aa  328  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  87.31 
 
 
193 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  87.31 
 
 
193 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  80.71 
 
 
193 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  86.29 
 
 
193 aa  308  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  70.92 
 
 
188 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  66.21 
 
 
189 aa  217  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  64.63 
 
 
186 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  52.13 
 
 
187 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  61.38 
 
 
591 aa  194  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.3 
 
 
435 aa  193  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  61.27 
 
 
592 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.31 
 
 
609 aa  191  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  60.69 
 
 
589 aa  191  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  52.27 
 
 
604 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  56.03 
 
 
589 aa  188  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  57.45 
 
 
596 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  57.45 
 
 
626 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  55.8 
 
 
581 aa  181  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  55.32 
 
 
622 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  55.17 
 
 
404 aa  180  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  56.25 
 
 
403 aa  180  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  57.45 
 
 
623 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  52.78 
 
 
589 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.93 
 
 
596 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  53.9 
 
 
469 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.85 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  55.32 
 
 
691 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  56.03 
 
 
622 aa  177  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  56.03 
 
 
625 aa  177  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  56.03 
 
 
619 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  56.03 
 
 
619 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  56.03 
 
 
619 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  53.42 
 
 
695 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  52.98 
 
 
659 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50.7 
 
 
466 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50 
 
 
466 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  53.38 
 
 
598 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  46.29 
 
 
184 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  52.14 
 
 
576 aa  170  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  47.43 
 
 
178 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  41.38 
 
 
369 aa  167  6e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  46.86 
 
 
178 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.42 
 
 
570 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  45.14 
 
 
178 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  45.03 
 
 
381 aa  149  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  43.17 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  39.38 
 
 
674 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  40.43 
 
 
581 aa  122  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.29 
 
 
493 aa  121  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  39.19 
 
 
697 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  37.93 
 
 
503 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.43 
 
 
641 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.19 
 
 
612 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.41 
 
 
639 aa  117  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.41 
 
 
612 aa  117  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.31 
 
 
688 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  36.99 
 
 
634 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  38.71 
 
 
644 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.99 
 
 
612 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  40.25 
 
 
672 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.02 
 
 
628 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  38.41 
 
 
699 aa  112  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  43.65 
 
 
584 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  38.19 
 
 
498 aa  105  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  40.16 
 
 
504 aa  101  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  36.88 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  34.19 
 
 
487 aa  86.7  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  34.25 
 
 
173 aa  85.1  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  32.79 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  31.13 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.88 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.65 
 
 
184 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  31.79 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  32.74 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  24.4 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  33.91 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  30.95 
 
 
160 aa  72  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  29.14 
 
 
172 aa  72  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  27.14 
 
 
173 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  24.71 
 
 
173 aa  72  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  27.14 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  32.03 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.81 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  33.09 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  25 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  28.25 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  31.82 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  24.4 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  35.78 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  32.31 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.1 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  28.97 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  32.69 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  33.59 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  27.21 
 
 
470 aa  68.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  24.4 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>