111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4253 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  100 
 
 		 584 aa  1115    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.09 
 
 		 612 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.33 
 
 		 612 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45 
 
 		 612 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  44.33 
 
 		 634 aa  398  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.1 
 
 		 641 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  40.58 
 
 		 672 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.6 
 
 		 639 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.94 
 
 		 688 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  40.58 
 
 		 674 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.33 
 
 		 628 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  40 
 
 		 699 aa  372  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  42.74 
 
 		 644 aa  364  3e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  43.44 
 
 		 697 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  35.81 
 
 		 581 aa  280  5e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.96 
 
 		 493 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  35.61 
 
 		 504 aa  261  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  35.31 
 
 		 503 aa  247  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  32.12 
 
 		 498 aa  205  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  35.23 
 
 		 487 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  32.64 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  30.87 
 
 		 470 aa  127  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  43.65 
 
 		 197 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  41.1 
 
 		 193 aa  109  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  43.33 
 
 		 193 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  43.33 
 
 		 193 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  43.31 
 
 		 193 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 197 aa  108  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  41.43 
 
 		 193 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  36.84 
 
 		 189 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  35.66 
 
 		 186 aa  97.8  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  36.88 
 
 		 187 aa  95.5  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  30.81 
 
 		 652 aa  93.6  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  33.57 
 
 		 369 aa  92.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.68 
 
 		 596 aa  91.3  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.5 
 
 		 623 aa  90.5  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.18 
 
 		 589 aa  90.5  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.5 
 
 		 619 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.5 
 
 		 619 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.5 
 
 		 619 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.5 
 
 		 625 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  36.09 
 
 		 188 aa  88.6  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.5 
 
 		 622 aa  88.2  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.82 
 
 		 435 aa  87.4  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  35.16 
 
 		 591 aa  87.4  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.24 
 
 		 626 aa  87  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  39.34 
 
 		 622 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  37.8 
 
 		 589 aa  86.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.23 
 
 		 570 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  36.23 
 
 		 592 aa  85.9  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  41.28 
 
 		 178 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.62 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  39.82 
 
 		 178 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  38.32 
 
 		 695 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.53 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  38.94 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.72 
 
 		 589 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.53 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  33.55 
 
 		 604 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  38.02 
 
 		 691 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  36.75 
 
 		 469 aa  83.2  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  27.48 
 
 		 439 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.17 
 
 		 598 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.05 
 
 		 609 aa  82.8  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  38.06 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.22 
 
 		 576 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  31.25 
 
 		 659 aa  81.6  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  38.89 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  35.07 
 
 		 581 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.48 
 
 		 596 aa  77.4  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  35.12 
 
 		 249 aa  76.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.58 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.58 
 
 		 466 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  29.32 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1051 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1030 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6443  NHL repeat containing protein  33.07 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.92 
 
 		 1750 aa  65.1  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  29.7 
 
 		 623 aa  63.9  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  26.33 
 
 		 1351 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1763 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  29.7 
 
 		 2296 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 		 892 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.67 
 
 		 1130 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  30.42 
 
 		 850 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  30.32 
 
 		 963 aa  60.5  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.02 
 
 		 693 aa  56.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.02 
 
 		 1292 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1026 aa  53.9  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  28.21 
 
 		 425 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  24.85 
 
 		 646 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  31.9 
 
 		 173 aa  52  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  33.2 
 
 		 772 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  24.05 
 
 		 522 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 		 863 aa  50.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  25 
 
 		 831 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  30.07 
 
 		 611 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0867  Redoxin domain protein  39.39 
 
 		 353 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0679  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.71 
 
 		 167 aa  47.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  29.32 
 
 		 2831 aa  47.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>