113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1791 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 425 aa  862    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  33.89 
 
 		 1030 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  35.73 
 
 		 1750 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  34.6 
 
 		 1351 aa  166  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  35.33 
 
 		 850 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  36.52 
 
 		 772 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 		 892 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  33.13 
 
 		 1763 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  35.26 
 
 		 623 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  34.91 
 
 		 2831 aa  120  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.13 
 
 		 1292 aa  117  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 		 770 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  32.07 
 
 		 719 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  30.55 
 
 		 732 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.97 
 
 		 1130 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  30.5 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  31.79 
 
 		 2296 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  29.64 
 
 		 1051 aa  103  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  27.76 
 
 		 646 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1026 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  27.15 
 
 		 1079 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  40.51 
 
 		 863 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  28.14 
 
 		 963 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  32.14 
 
 		 498 aa  93.6  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.93 
 
 		 693 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  28.9 
 
 		 652 aa  90.9  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  29.83 
 
 		 1046 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  34.97 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  33.11 
 
 		 487 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3618  hypothetical protein  28.33 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  38.36 
 
 		 756 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  30.46 
 
 		 807 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  28.02 
 
 		 581 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  31.27 
 
 		 1916 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  27.94 
 
 		 2350 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.76 
 
 		 641 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.37 
 
 		 639 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  27.01 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  26.73 
 
 		 672 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  27.74 
 
 		 930 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  27.69 
 
 		 805 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  34.27 
 
 		 2961 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  21.94 
 
 		 668 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  27.68 
 
 		 674 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.12 
 
 		 612 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  25.79 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  24.41 
 
 		 676 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  28.52 
 
 		 699 aa  72.4  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  21.41 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  28.67 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  25.98 
 
 		 634 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  30.1 
 
 		 841 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  27.37 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  25.68 
 
 		 697 aa  69.7  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  27.92 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13808  predicted protein  28.16 
 
 		 1675 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0947447  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  23.22 
 
 		 831 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.47 
 
 		 628 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.62 
 
 		 612 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1163 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0567  NHL repeat containing protein  35.92 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  23.23 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  24.91 
 
 		 522 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.61 
 
 		 612 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1146 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  24.01 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  20.72 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1030 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  25.09 
 
 		 322 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3599  hypothetical protein  38.64 
 
 		 694 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161985  decreased coverage  0.00880556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  22.65 
 
 		 1293 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  28.87 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  21.5 
 
 		 1834 aa  60.1  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  26.01 
 
 		 627 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  22.43 
 
 		 709 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  21.1 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  25.79 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  25.19 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  24.62 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  30.54 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  24.81 
 
 		 326 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  23.48 
 
 		 700 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  28.21 
 
 		 584 aa  53.5  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  24.12 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0941  hypothetical protein  47.54 
 
 		 791 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.10709 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  21.65 
 
 		 491 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  25.83 
 
 		 644 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  20.12 
 
 		 354 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6443  NHL repeat containing protein  26.24 
 
 		 344 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  22.19 
 
 		 359 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  19.78 
 
 		 752 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  23 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  25.93 
 
 		 1140 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 353 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  23.94 
 
 		 1208 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  25.49 
 
 		 328 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  26.09 
 
 		 711 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0233  hypothetical protein  22.75 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  22.99 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>