212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0556 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  42.21 
 
 		 1026 aa  647    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  100 
 
 		 1130 aa  2258    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  43 
 
 		 1292 aa  494  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  39.02 
 
 		 963 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.54 
 
 		 826 aa  345  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.3 
 
 		 714 aa  337  7e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  52.12 
 
 		 1848 aa  329  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  51.18 
 
 		 810 aa  328  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.58 
 
 		 805 aa  328  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43 
 
 		 1383 aa  327  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.04 
 
 		 540 aa  324  8e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.29 
 
 		 1126 aa  323  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  43.75 
 
 		 633 aa  320  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  51.92 
 
 		 2802 aa  317  7e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  50.73 
 
 		 1178 aa  315  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  46.79 
 
 		 721 aa  313  9e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  48.14 
 
 		 920 aa  308  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  49.55 
 
 		 1195 aa  308  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  47.83 
 
 		 884 aa  306  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.8 
 
 		 1221 aa  304  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.23 
 
 		 1607 aa  300  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.24 
 
 		 887 aa  300  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.08 
 
 		 1507 aa  290  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.95 
 
 		 1183 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  45.8 
 
 		 1255 aa  284  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  40.35 
 
 		 640 aa  281  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  55.17 
 
 		 1285 aa  278  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  46.27 
 
 		 862 aa  276  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  34.56 
 
 		 1750 aa  275  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.85 
 
 		 1176 aa  271  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  43.96 
 
 		 408 aa  270  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  45.51 
 
 		 791 aa  268  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  43.18 
 
 		 1176 aa  267  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  44.52 
 
 		 462 aa  257  9e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.87 
 
 		 701 aa  257  9e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  45.9 
 
 		 933 aa  252  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  40.86 
 
 		 664 aa  250  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  31.01 
 
 		 831 aa  234  8.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  43.21 
 
 		 439 aa  229  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  41.55 
 
 		 3563 aa  228  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  47.15 
 
 		 648 aa  222  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  42.77 
 
 		 1051 aa  216  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  40.44 
 
 		 2296 aa  201  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  43.32 
 
 		 646 aa  193  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  34.87 
 
 		 652 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  28.64 
 
 		 930 aa  191  8e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  41.22 
 
 		 288 aa  190  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  28.34 
 
 		 676 aa  184  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  29.93 
 
 		 668 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  35.77 
 
 		 1030 aa  173  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.7 
 
 		 1293 aa  169  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  33.15 
 
 		 1351 aa  161  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  42.32 
 
 		 1083 aa  159  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  25.67 
 
 		 588 aa  159  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  35.93 
 
 		 892 aa  155  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.38 
 
 		 693 aa  153  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  36.01 
 
 		 850 aa  153  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  32.62 
 
 		 1763 aa  145  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  34.03 
 
 		 772 aa  138  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  31.33 
 
 		 2831 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  33.55 
 
 		 359 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 807 aa  128  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  35.58 
 
 		 863 aa  127  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  30 
 
 		 346 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  32.59 
 
 		 522 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  28.97 
 
 		 627 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  27 
 
 		 510 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  29.52 
 
 		 841 aa  116  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  28.53 
 
 		 392 aa  109  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  31.35 
 
 		 387 aa  109  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 		 719 aa  108  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.1 
 
 		 752 aa  107  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  35.13 
 
 		 404 aa  105  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  27.54 
 
 		 390 aa  105  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  27.97 
 
 		 425 aa  105  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 732 aa  105  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.53 
 
 		 343 aa  104  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  32.5 
 
 		 623 aa  103  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  29.21 
 
 		 491 aa  103  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 		 770 aa  101  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.33 
 
 		 709 aa  99.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  41.87 
 
 		 460 aa  97.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  28.24 
 
 		 1030 aa  97.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  29.25 
 
 		 2961 aa  96.3  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  32.33 
 
 		 504 aa  95.1  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  30.51 
 
 		 1046 aa  95.1  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  27.46 
 
 		 579 aa  93.6  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  26.55 
 
 		 2350 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  26.35 
 
 		 391 aa  92  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  33.69 
 
 		 930 aa  91.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1068 aa  88.6  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  26.35 
 
 		 448 aa  88.2  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  27.19 
 
 		 634 aa  86.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.21 
 
 		 628 aa  86.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  28.66 
 
 		 503 aa  85.9  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  33.74 
 
 		 672 aa  85.5  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  34.23 
 
 		 14944 aa  85.5  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 756 aa  84.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  32.61 
 
 		 487 aa  83.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.34 
 
 		 639 aa  81.6  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>