74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0567 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0567  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 453 aa  940    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  22.56 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  49.44 
 
 		 693 aa  88.2  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.37 
 
 		 2296 aa  83.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.74 
 
 		 1292 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  44.33 
 
 		 963 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1030 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  40.21 
 
 		 646 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  41.76 
 
 		 1750 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.76 
 
 		 1130 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  44.55 
 
 		 850 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  46.99 
 
 		 1026 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  47.87 
 
 		 1351 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  41.84 
 
 		 510 aa  73.6  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  40.22 
 
 		 2831 aa  73.2  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1051 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 807 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1763 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  35.92 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  40.43 
 
 		 892 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  41.46 
 
 		 623 aa  63.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  34.29 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  37.89 
 
 		 652 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  34.41 
 
 		 1046 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  39.13 
 
 		 772 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  36.78 
 
 		 930 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 		 732 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  36.56 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  40.23 
 
 		 676 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  30.68 
 
 		 627 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  39.56 
 
 		 579 aa  54.3  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 831 aa  53.9  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  36.9 
 
 		 930 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  31.91 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.84 
 
 		 641 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  29.89 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.68 
 
 		 612 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  35 
 
 		 522 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  27.03 
 
 		 634 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.43 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  34.74 
 
 		 2350 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  38.27 
 
 		 1140 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 		 863 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  34.94 
 
 		 668 aa  50.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.68 
 
 		 612 aa  50.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  33.73 
 
 		 391 aa  50.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  29.7 
 
 		 709 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  36.14 
 
 		 1079 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 		 639 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  36.96 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  31.53 
 
 		 672 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  41.67 
 
 		 1146 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  28.83 
 
 		 752 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6443  NHL repeat containing protein  30.95 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  33.04 
 
 		 1163 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  31.82 
 
 		 322 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  30.69 
 
 		 674 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  28.89 
 
 		 841 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  34.88 
 
 		 1030 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  31.46 
 
 		 805 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  30.68 
 
 		 279 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  32.29 
 
 		 699 aa  47  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  28.45 
 
 		 2961 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  40 
 
 		 1916 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 		 719 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  34.15 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  27.71 
 
 		 588 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  35.71 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  32.53 
 
 		 1293 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 		 770 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  30.67 
 
 		 491 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  32.32 
 
 		 470 aa  44.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.57 
 
 		 664 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>