276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  70.76 
 
 
641 aa  855    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.55 
 
 
612 aa  663    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  64.57 
 
 
688 aa  798    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  55.24 
 
 
699 aa  680    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  100 
 
 
634 aa  1252    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.52 
 
 
612 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  54.6 
 
 
672 aa  678    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  71.72 
 
 
639 aa  872    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.78 
 
 
612 aa  686    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  55.26 
 
 
674 aa  684    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.24 
 
 
628 aa  806    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  47.88 
 
 
697 aa  585  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  52.68 
 
 
644 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  44.5 
 
 
584 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.21 
 
 
493 aa  324  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  38.56 
 
 
503 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  38.08 
 
 
504 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  34.3 
 
 
581 aa  282  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  34.86 
 
 
498 aa  256  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  34 
 
 
487 aa  206  9e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  30.82 
 
 
470 aa  146  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  30.58 
 
 
472 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  37.68 
 
 
197 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  36.99 
 
 
197 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  38.81 
 
 
193 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.78 
 
 
589 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  36.69 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  34.78 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.55 
 
 
435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  37.31 
 
 
193 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  38.84 
 
 
193 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  38.84 
 
 
193 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.82 
 
 
589 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.82 
 
 
596 aa  107  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  36.88 
 
 
187 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  31.71 
 
 
589 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.53 
 
 
609 aa  106  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  37.04 
 
 
193 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.54 
 
 
576 aa  104  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  33.56 
 
 
369 aa  103  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  29.46 
 
 
591 aa  104  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  37.31 
 
 
469 aa  103  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  35.29 
 
 
581 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  35.82 
 
 
622 aa  102  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  32.92 
 
 
592 aa  102  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  33.15 
 
 
381 aa  100  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.07 
 
 
596 aa  100  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  33.82 
 
 
695 aa  100  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  31.01 
 
 
188 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  34.33 
 
 
691 aa  98.2  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.84 
 
 
466 aa  97.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  33.58 
 
 
604 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  33.81 
 
 
659 aa  95.9  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 
850 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.83 
 
 
570 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.84 
 
 
466 aa  96.3  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.07 
 
 
626 aa  93.6  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.12 
 
 
404 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.12 
 
 
403 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.16 
 
 
598 aa  91.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  35.07 
 
 
184 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  28.44 
 
 
439 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.33 
 
 
622 aa  89.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.33 
 
 
625 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  28.95 
 
 
1750 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.58 
 
 
623 aa  88.6  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.33 
 
 
619 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.33 
 
 
619 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.33 
 
 
619 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  35.07 
 
 
178 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.33 
 
 
200 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.19 
 
 
1130 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  35.07 
 
 
178 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  34.71 
 
 
178 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  26.62 
 
 
1051 aa  81.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  31.84 
 
 
623 aa  81.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  29.95 
 
 
652 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  35.66 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  28.82 
 
 
2296 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
772 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 
892 aa  77.4  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  27.95 
 
 
1763 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  29.29 
 
 
963 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.38 
 
 
693 aa  75.1  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
719 aa  74.3  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  26.58 
 
 
1030 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.77 
 
 
1292 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  25.98 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6443  NHL repeat containing protein  28.49 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  29.05 
 
 
646 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  29.11 
 
 
1026 aa  67.4  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0211  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.94 
 
 
187 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.506232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0192  hypothetical protein  35.94 
 
 
187 aa  65.1  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  34.44 
 
 
2350 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  27.87 
 
 
403 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.4 
 
 
1351 aa  61.6  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.23 
 
 
199 aa  61.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  27.87 
 
 
403 aa  61.2  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  29.85 
 
 
168 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.12 
 
 
173 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>