More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4090 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
756 aa  1445    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  36.27 
 
 
719 aa  289  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  54.29 
 
 
737 aa  281  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6773  serine/threonine protein kinase  57.65 
 
 
518 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117813  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  48.02 
 
 
863 aa  269  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  51.23 
 
 
892 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  53 
 
 
716 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  52.51 
 
 
807 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0242  serine/threonine protein kinase  53.31 
 
 
295 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  50.34 
 
 
682 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
770 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4910  serine/threonine protein kinase  40.18 
 
 
552 aa  198  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104206  decreased coverage  0.00224255 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.25 
 
 
584 aa  178  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  42.08 
 
 
666 aa  170  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  40.38 
 
 
457 aa  169  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  40.22 
 
 
863 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  38 
 
 
612 aa  167  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  36.92 
 
 
612 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  39.18 
 
 
621 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  39.49 
 
 
1053 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  40.82 
 
 
850 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.35 
 
 
614 aa  162  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.54 
 
 
598 aa  161  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.8 
 
 
627 aa  160  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  40.23 
 
 
1057 aa  160  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.05 
 
 
641 aa  159  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
628 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.88 
 
 
627 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.47 
 
 
632 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  35.04 
 
 
691 aa  158  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  41.51 
 
 
617 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 
703 aa  157  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.58 
 
 
579 aa  157  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  37.42 
 
 
618 aa  157  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  37.64 
 
 
559 aa  157  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  38.11 
 
 
450 aa  156  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  35.04 
 
 
692 aa  157  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  33.46 
 
 
638 aa  156  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  36.98 
 
 
772 aa  156  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.01 
 
 
668 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  39.26 
 
 
1351 aa  155  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  38.15 
 
 
520 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.5 
 
 
603 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  37.5 
 
 
609 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  37 
 
 
596 aa  155  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1104  serine/threonine protein kinase  40.67 
 
 
607 aa  154  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.511251  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  37.64 
 
 
646 aa  154  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  39.64 
 
 
1034 aa  154  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  36.78 
 
 
776 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  38.49 
 
 
464 aa  154  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 
382 aa  153  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  39.22 
 
 
468 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  39.08 
 
 
758 aa  152  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  38.87 
 
 
599 aa  152  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  38.95 
 
 
497 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.42 
 
 
650 aa  152  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  36.09 
 
 
620 aa  152  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  37.77 
 
 
951 aa  151  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  37.26 
 
 
1122 aa  151  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  40.31 
 
 
1032 aa  151  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  40.31 
 
 
1032 aa  151  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.64 
 
 
662 aa  150  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.09 
 
 
562 aa  150  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1401  serine/threonine protein kinase  38.11 
 
 
1333 aa  150  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  35.79 
 
 
604 aa  150  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.4 
 
 
740 aa  150  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  41.09 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0382  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 
583 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.69 
 
 
681 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  37.26 
 
 
1479 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  37.4 
 
 
1104 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1995  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.1 
 
 
682 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215989  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 
894 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.49 
 
 
1044 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1202  serine/threonine protein kinase  39.54 
 
 
655 aa  148  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.62 
 
 
528 aa  148  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  33.63 
 
 
565 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  35.12 
 
 
586 aa  148  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  37.75 
 
 
611 aa  148  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  39.86 
 
 
572 aa  148  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  34.3 
 
 
543 aa  148  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.7 
 
 
658 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  39.85 
 
 
464 aa  147  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 
641 aa  147  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.85 
 
 
602 aa  147  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.98 
 
 
664 aa  147  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4435  serine/threonine protein kinase  38.75 
 
 
542 aa  147  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  35.97 
 
 
619 aa  147  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  34.96 
 
 
667 aa  147  9e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.7 
 
 
518 aa  147  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  38.93 
 
 
1018 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.32 
 
 
880 aa  147  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3623  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 
715 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.569481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 
862 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0821  Serine/threonine protein kinase-related protein  41.53 
 
 
525 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5621  serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 
845 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205775  normal  0.427226 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  35.4 
 
 
1030 aa  145  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  37 
 
 
866 aa  146  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  35.14 
 
 
692 aa  145  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  34.96 
 
 
690 aa  144  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>