More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0196 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  100 
 
 		 185 aa  380  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  95.83 
 
 		 186 aa  340  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  82.7 
 
 		 213 aa  322  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  70.29 
 
 		 178 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  62.98 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  65.71 
 
 		 174 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  75.69 
 
 		 176 aa  234  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  75 
 
 		 176 aa  232  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  70.47 
 
 		 194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  69.8 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  69.8 
 
 		 178 aa  217  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  69.13 
 
 		 178 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  69.13 
 
 		 178 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2256  redoxin  69.8 
 
 		 178 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2870  redoxin domain-containing protein  69.8 
 
 		 178 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0218082  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  60.44 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  60.44 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  59.89 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  60.44 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  60.44 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  60.44 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  60.44 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  60.44 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0270  putative transmembrane protein  59.57 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  59.57 
 
 		 165 aa  188  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0217  redoxin domain-containing protein  58.87 
 
 		 171 aa  185  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  58.16 
 
 		 167 aa  184  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  58.16 
 
 		 167 aa  184  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  59.12 
 
 		 168 aa  181  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  57.78 
 
 		 203 aa  177  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  53.85 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  59.4 
 
 		 164 aa  174  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1278  redoxin domain-containing protein  52.17 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.78 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  47.65 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  45.95 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  41.67 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  34.13 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  37.42 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.1 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  36.44 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  34.12 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  33.73 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  37.7 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  34.71 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  33.14 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  33.14 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  33.14 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  33.14 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  33.14 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  42.34 
 
 		 167 aa  94.4  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  32.54 
 
 		 173 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  32.54 
 
 		 173 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  34.57 
 
 		 173 aa  94  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  30.59 
 
 		 174 aa  92.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  26.17 
 
 		 172 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  31.09 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  36.84 
 
 		 168 aa  89  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  35.42 
 
 		 170 aa  89  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  34.31 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.89 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.12 
 
 		 169 aa  88.6  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  38.17 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.12 
 
 		 169 aa  87.8  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  35.06 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.89 
 
 		 171 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.61 
 
 		 189 aa  84.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  29.45 
 
 		 171 aa  84.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  37.3 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  33.33 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.06 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.66 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  31.06 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  35.2 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  31.88 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  38.46 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  37.07 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.37 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.07 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  38.02 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  38.02 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  38.02 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  38.02 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  31.58 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  30.3 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  38.02 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  33.09 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  29.93 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.96 
 
 		 228 aa  77.8  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  32 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.02 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  38.02 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  38.02 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  37.19 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.51 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  31.82 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2908  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  33.86 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629655  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  31.85 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  33.76 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  37.19 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>