More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0333 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  100 
 
 		 213 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  82.7 
 
 		 185 aa  322  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  85.71 
 
 		 186 aa  314  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  66.67 
 
 		 179 aa  258  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  74.1 
 
 		 178 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  75 
 
 		 176 aa  230  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  75.69 
 
 		 176 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  67.31 
 
 		 174 aa  225  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  69.8 
 
 		 194 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  69.8 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  69.8 
 
 		 178 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2256  redoxin  69.8 
 
 		 178 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  69.13 
 
 		 178 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2870  redoxin domain-containing protein  69.8 
 
 		 178 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0218082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  69.13 
 
 		 178 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  68.97 
 
 		 178 aa  214  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  68.97 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  68.97 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  68.97 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  68.97 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  68.97 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  68.97 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  68.97 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0270  putative transmembrane protein  63.12 
 
 		 174 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0217  redoxin domain-containing protein  61.7 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  59.57 
 
 		 165 aa  187  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  56.74 
 
 		 167 aa  181  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  56.74 
 
 		 167 aa  181  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  57.34 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  60 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  56.93 
 
 		 168 aa  175  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  56.72 
 
 		 164 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  50.34 
 
 		 166 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1278  redoxin domain-containing protein  47.56 
 
 		 167 aa  164  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.37 
 
 		 173 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  44.59 
 
 		 165 aa  141  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  39.53 
 
 		 167 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  37.09 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.99 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  36.65 
 
 		 165 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  33.9 
 
 		 169 aa  101  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  32.14 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  32.14 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  41.44 
 
 		 172 aa  97.1  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  45.1 
 
 		 167 aa  95.1  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  32.74 
 
 		 173 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  32.74 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  32.74 
 
 		 173 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  32.74 
 
 		 173 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  32.74 
 
 		 173 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  32.74 
 
 		 173 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  32.74 
 
 		 173 aa  92  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  32.14 
 
 		 173 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  32.14 
 
 		 173 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  33.14 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  30.25 
 
 		 172 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  30.25 
 
 		 165 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  33.58 
 
 		 183 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  34.03 
 
 		 170 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.82 
 
 		 169 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.82 
 
 		 169 aa  85.1  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 		 189 aa  85.1  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  35.21 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  36.23 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  29.45 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.36 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  34.11 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  35.88 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.85 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  31.03 
 
 		 173 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  28.24 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.24 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  31.97 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  32.86 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  31.82 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1492  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.65 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.19 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  35 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  35 
 
 		 184 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  35 
 
 		 184 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  35 
 
 		 184 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  35 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.19 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  35 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  35 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.83 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  32 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  35.16 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  31.54 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  34.17 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  32.84 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  34.17 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  31.34 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.19 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  30.66 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2803  putative thioredoxin  34.55 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  33.06 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  32.92 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  31.16 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1313  Redoxin domain protein  31.43 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000515497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>