More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2925 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  99.44 
 
 		 178 aa  363  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 178 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  96.63 
 
 		 178 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2256  redoxin  96.07 
 
 		 178 aa  328  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2870  redoxin domain-containing protein  96.07 
 
 		 178 aa  328  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0218082  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  95.53 
 
 		 179 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  94.38 
 
 		 194 aa  321  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  87.21 
 
 		 178 aa  299  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  86.05 
 
 		 178 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  86.05 
 
 		 178 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  86.05 
 
 		 178 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  86.05 
 
 		 178 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  86.05 
 
 		 178 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  86.05 
 
 		 178 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  86.05 
 
 		 178 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  79.39 
 
 		 174 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  81.61 
 
 		 176 aa  274  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  79.89 
 
 		 176 aa  268  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  68.18 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  64.94 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  63.64 
 
 		 185 aa  227  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  64.12 
 
 		 186 aa  224  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  72.48 
 
 		 178 aa  221  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  61.87 
 
 		 168 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  59.59 
 
 		 203 aa  185  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0270  putative transmembrane protein  60.71 
 
 		 174 aa  184  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  59.29 
 
 		 167 aa  182  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  59.29 
 
 		 167 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  59.29 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0217  redoxin domain-containing protein  59.29 
 
 		 171 aa  177  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  55.24 
 
 		 166 aa  174  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  60.14 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1278  redoxin domain-containing protein  50 
 
 		 167 aa  165  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  48.68 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  49.66 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.77 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  41.01 
 
 		 167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.54 
 
 		 171 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  35.62 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  30.3 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  32.39 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  36.09 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  32.93 
 
 		 173 aa  94  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  37.23 
 
 		 167 aa  93.2  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  32.73 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  32.73 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  33.54 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  33.54 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  33.54 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  33.54 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  34.59 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  33.54 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  32.93 
 
 		 173 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  29.24 
 
 		 174 aa  88.6  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  36.64 
 
 		 180 aa  87.8  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  32.12 
 
 		 173 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.69 
 
 		 175 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  31.25 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.19 
 
 		 184 aa  84.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  35.16 
 
 		 168 aa  84.3  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.48 
 
 		 169 aa  84  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.65 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  31.58 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.56 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.61 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  28.48 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  28.48 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  30.23 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1981  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.09 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0214492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.58 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.59 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  35.29 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  35 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  33.09 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  30.51 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  34.04 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  36.07 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  35.65 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  34.29 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  27.98 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.41 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  35.07 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  35.07 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  35.07 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  35.07 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  35.07 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.43 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  32.47 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  32.37 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  32.37 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  32.37 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  32.37 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  32.47 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  33.09 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  30 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  35.07 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  31.82 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  35.07 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  33.09 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.05 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>