40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0470 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0470  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  744    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.043698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  68.02 
 
 		 398 aa  519  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0790  NHL repeat-containing protein  51.5 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.395295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1812  NHL repeat containing protein  51.36 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  49.86 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0113  NHL repeat containing protein  49.59 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3206  NHL repeat-containing protein  51.76 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4601  NHL repeat-containing protein  49.06 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3874  NHL repeat containing protein  47.31 
 
 		 388 aa  356  3.9999999999999996e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0859  NHL repeat containing protein  50 
 
 		 398 aa  346  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0711  NHL repeat protein  50 
 
 		 398 aa  346  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3798  NHL repeat-containing protein  41.41 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.88272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  40.06 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  40.11 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1073  NHL repeat-containing protein  40.86 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0871328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2370  NHL repeat-containing protein  40.68 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3876  NHL repeat containing protein  38.08 
 
 		 379 aa  232  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  27.27 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  25.96 
 
 		 711 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  30.13 
 
 		 1177 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  27.55 
 
 		 470 aa  55.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  24.63 
 
 		 1079 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  26.16 
 
 		 472 aa  53.1  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  26.48 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  27.97 
 
 		 522 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1146 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  25.79 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  30.22 
 
 		 1163 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  33.13 
 
 		 1750 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  24.41 
 
 		 831 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  26.85 
 
 		 1026 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  28.5 
 
 		 1834 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25.53 
 
 		 668 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  34.41 
 
 		 581 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0414  NHL repeat containing protein  26.35 
 
 		 803 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316951  normal  0.387155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  23 
 
 		 1030 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  25.72 
 
 		 498 aa  43.9  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  33.06 
 
 		 699 aa  43.5  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  31.01 
 
 		 639 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  25.91 
 
 		 460 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>