60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0890 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0890  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  608  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5515  triple helix repeat-containing collagen  59.64 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.742709  normal  0.284565 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  31.05 
 
 		 882 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  30.41 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  29.49 
 
 		 652 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0788  LVIVD repeat-containing protein  23.71 
 
 		 645 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0658316  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  25 
 
 		 498 aa  66.6  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  27.87 
 
 		 2096 aa  65.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  28.44 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  31.49 
 
 		 1834 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  23.2 
 
 		 472 aa  62.8  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  25.46 
 
 		 470 aa  62.8  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  23.88 
 
 		 4231 aa  62.4  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  22.18 
 
 		 652 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  29.47 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 		 1334 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  24.23 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.79 
 
 		 932 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1030 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  27.48 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  22.05 
 
 		 1265 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  26.79 
 
 		 930 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  29.81 
 
 		 1293 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.76 
 
 		 828 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  18.33 
 
 		 833 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  21.01 
 
 		 1344 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.31 
 
 		 729 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  30.13 
 
 		 668 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  21.12 
 
 		 504 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.95 
 
 		 493 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0082  LVIVD repeat protein  26.89 
 
 		 256 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3830  WD-40 repeat protein  20.92 
 
 		 709 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171146  normal  0.119084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.95 
 
 		 716 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  22.31 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.33 
 
 		 11716 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  25.77 
 
 		 460 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.02 
 
 		 737 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3663  LVIVD repeat protein  23 
 
 		 385 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022114  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0291  NHL repeat-containing protein  30.77 
 
 		 669 aa  46.2  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  24.02 
 
 		 346 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  26.88 
 
 		 700 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.26 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.22 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1152 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  24.67 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.31 
 
 		 898 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1588  HAD family hydrolase  25 
 
 		 835 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  22.35 
 
 		 581 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.5 
 
 		 818 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  24.63 
 
 		 14944 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  22.99 
 
 		 1230 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.77 
 
 		 521 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  31.58 
 
 		 819 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  27.78 
 
 		 491 aa  43.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  18.12 
 
 		 757 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  28.74 
 
 		 711 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  35.77 
 
 		 446 aa  42.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.5 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.65 
 
 		 522 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  30.09 
 
 		 630 aa  42.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>