186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1627 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1627  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  893    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2566  hypothetical protein  47.97 
 
 		 468 aa  398  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0965859  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1940  hypothetical protein  46.2 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1880  hypothetical protein  37.9 
 
 		 453 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0381  hypothetical protein  27.49 
 
 		 381 aa  97.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.71003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0586  putative receptor  26.32 
 
 		 358 aa  93.2  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1704  hypothetical protein  27.06 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188458  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1765  hypothetical protein  26.82 
 
 		 353 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1701  hypothetical protein  26.82 
 
 		 353 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.117434  normal  0.828136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1574  putative periplasmic protein  26.82 
 
 		 353 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000189121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.16 
 
 		 752 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1755  hypothetical protein  26.82 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0322938  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01409  hypothetical protein  26.64 
 
 		 353 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1724  hypothetical protein  26.64 
 
 		 353 aa  86.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2207  putative receptor  26.64 
 
 		 353 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0362062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01420  hypothetical protein  26.64 
 
 		 353 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2058  hypothetical protein  26.16 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132417  hitchhiker  0.00041859 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1719  hypothetical protein  26.32 
 
 		 353 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023319 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1634  hypothetical protein  26.64 
 
 		 353 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.679597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2098  hypothetical protein  26.01 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1539  hypothetical protein  26.32 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2194  putative receptor  26.32 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000873978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3495  putative receptor  24.38 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1100  putative receptor  21.56 
 
 		 352 aa  79.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  26.52 
 
 		 819 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.59 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5134  hypothetical protein  28.99 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0254476  normal  0.895353 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.92 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.06 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  32.37 
 
 		 1094 aa  70.5  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  30.34 
 
 		 479 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.41 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.51 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.35 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.97 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  26.64 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.68 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1704  hypothetical protein  25.62 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0895  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.7 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1667 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  25.94 
 
 		 580 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  29.5 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.53 
 
 		 689 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  25.94 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.5 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.92 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.67 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.08 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  30.23 
 
 		 810 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.27 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1057  putative periplasmic protein  24.3 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00889034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.44 
 
 		 943 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  22.52 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  23.85 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.05 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.71 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 154 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  26.63 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.55 
 
 		 974 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.87 
 
 		 332 aa  56.6  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.52 
 
 		 314 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.88 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.84 
 
 		 310 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 		 776 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.12 
 
 		 312 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  25.38 
 
 		 971 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.56 
 
 		 335 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.97 
 
 		 517 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  25 
 
 		 329 aa  54.3  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.46 
 
 		 362 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.66 
 
 		 607 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.01 
 
 		 324 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.74 
 
 		 406 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  25.6 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  25.37 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4611  hypothetical protein  32.56 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.04 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.03 
 
 		 601 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1189 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1477  hypothetical protein  32.56 
 
 		 330 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  32.29 
 
 		 1189 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.68 
 
 		 362 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.11 
 
 		 326 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.51 
 
 		 457 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1275  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.2 
 
 		 506 aa  50.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5421  WD-40 repeat-containing protein  34.91 
 
 		 354 aa  50.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1839  hypothetical protein  28.78 
 
 		 330 aa  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.172437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0312  hypothetical protein  26.9 
 
 		 332 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1749  hypothetical protein  28.78 
 
 		 330 aa  50.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2775  hypothetical protein  28.78 
 
 		 330 aa  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0332  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1066 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.635539  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2258  hypothetical protein  28.78 
 
 		 330 aa  50.1  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3062  hypothetical protein  28.78 
 
 		 330 aa  50.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0002291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2696  hypothetical protein  28.78 
 
 		 330 aa  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0538504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1529  hypothetical protein  28.78 
 
 		 330 aa  50.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.435429  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.21 
 
 		 345 aa  49.7  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2106  hypothetical protein  22.34 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.42 
 
 		 328 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>