47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2977 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2977  NHL repeat containing protein  100 
 
 
665 aa  1332    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0272113  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  25.08 
 
 
831 aa  84  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  24.96 
 
 
930 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  23.39 
 
 
668 aa  75.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  23.09 
 
 
676 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  28.57 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  29.27 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  28.85 
 
 
307 aa  65.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  26.07 
 
 
1030 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  30.53 
 
 
1293 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  25.29 
 
 
709 aa  60.1  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  32.78 
 
 
1140 aa  58.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1558  NHL repeat containing protein  34.13 
 
 
371 aa  55.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185852  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  28.11 
 
 
491 aa  55.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  25.67 
 
 
579 aa  54.7  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.05 
 
 
343 aa  54.7  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  25.95 
 
 
387 aa  53.9  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  28.14 
 
 
930 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  28.08 
 
 
627 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  26.53 
 
 
321 aa  51.6  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  27.09 
 
 
322 aa  51.6  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  32.14 
 
 
525 aa  50.8  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  28.29 
 
 
391 aa  50.8  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  29.08 
 
 
359 aa  50.8  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  28.63 
 
 
1750 aa  50.8  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  27.88 
 
 
630 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  27.04 
 
 
1146 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  24.41 
 
 
752 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  32.85 
 
 
930 aa  48.5  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  29.08 
 
 
315 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  31.51 
 
 
365 aa  48.1  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  26.21 
 
 
373 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.79 
 
 
1834 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  28.8 
 
 
899 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  24.32 
 
 
355 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  26.53 
 
 
1163 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  37.65 
 
 
418 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  24.57 
 
 
326 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  29.41 
 
 
898 aa  45.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  30.36 
 
 
355 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  24.51 
 
 
786 aa  45.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.96 
 
 
693 aa  44.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  27.32 
 
 
888 aa  44.3  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  30.85 
 
 
678 aa  44.3  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  24.64 
 
 
2831 aa  44.3  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  22.22 
 
 
1030 aa  43.9  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 
850 aa  43.9  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>