164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3430 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  45.99 
 
 		 888 aa  722    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  44.72 
 
 		 898 aa  707    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  41.93 
 
 		 899 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  49.51 
 
 		 906 aa  724    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  100 
 
 		 913 aa  1793    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  41.32 
 
 		 937 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  39.32 
 
 		 404 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  40 
 
 		 405 aa  240  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  31.27 
 
 		 1951 aa  183  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  36.81 
 
 		 2042 aa  161  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  34.67 
 
 		 1804 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  34.02 
 
 		 549 aa  145  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  33.27 
 
 		 3586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1902 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  37.93 
 
 		 777 aa  132  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  36.73 
 
 		 916 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1585 aa  114  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1588 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.58 
 
 		 346 aa  107  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  33.21 
 
 		 831 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  28.1 
 
 		 676 aa  102  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  29.14 
 
 		 930 aa  97.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  27.88 
 
 		 752 aa  95.5  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  28.65 
 
 		 2192 aa  94.4  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  29.35 
 
 		 3925 aa  94  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  30.34 
 
 		 668 aa  93.6  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  49.48 
 
 		 983 aa  90.5  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  26.76 
 
 		 579 aa  90.9  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  59.42 
 
 		 1241 aa  89.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  25.93 
 
 		 355 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  26.74 
 
 		 709 aa  82  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  35.45 
 
 		 6109 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  26.82 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  27.6 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  26.47 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  29.08 
 
 		 2528 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  27.39 
 
 		 3734 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  30.77 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  29.73 
 
 		 390 aa  77.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  30.43 
 
 		 694 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1474  hypothetical protein  32.95 
 
 		 383 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  25.48 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  33.16 
 
 		 1222 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  27.71 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  30.09 
 
 		 4689 aa  73.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  25.9 
 
 		 588 aa  73.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.57 
 
 		 343 aa  74.3  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  26.9 
 
 		 1293 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  25.32 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  25.45 
 
 		 627 aa  71.6  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  25.53 
 
 		 1030 aa  71.2  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  28.98 
 
 		 2927 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.79 
 
 		 4106 aa  70.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  29.07 
 
 		 355 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.29 
 
 		 3739 aa  70.1  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  28.35 
 
 		 3824 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  28.03 
 
 		 2625 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  29.74 
 
 		 2117 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  30.54 
 
 		 696 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  32.57 
 
 		 930 aa  68.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  43 
 
 		 1439 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  25.11 
 
 		 353 aa  67.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  26.32 
 
 		 307 aa  67  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  26.74 
 
 		 3736 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  28.31 
 
 		 2456 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  26.18 
 
 		 525 aa  66.2  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  28.35 
 
 		 3721 aa  65.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  26.02 
 
 		 3325 aa  65.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.63 
 
 		 3824 aa  65.1  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  28.8 
 
 		 3562 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.67 
 
 		 3552 aa  64.7  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.89 
 
 		 5216 aa  64.3  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  30.77 
 
 		 343 aa  63.9  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  27.5 
 
 		 387 aa  63.9  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  26.85 
 
 		 319 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  27.49 
 
 		 2704 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  28.31 
 
 		 3923 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  27.43 
 
 		 347 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  25.24 
 
 		 639 aa  63.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  28.07 
 
 		 3824 aa  63.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  25.19 
 
 		 4874 aa  62.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  22.64 
 
 		 1332 aa  62.8  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  27 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  32.84 
 
 		 1146 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  24.59 
 
 		 5559 aa  61.6  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0600  hypothetical protein  27.32 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  27.22 
 
 		 6310 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  24.78 
 
 		 372 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  25.09 
 
 		 5561 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  24.41 
 
 		 5559 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  25.18 
 
 		 368 aa  60.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  27.32 
 
 		 8064 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  24.48 
 
 		 363 aa  59.7  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  30.26 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  40 
 
 		 1919 aa  59.7  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  27.04 
 
 		 1140 aa  59.3  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  26.16 
 
 		 700 aa  59.3  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  25.55 
 
 		 7149 aa  58.9  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  24.23 
 
 		 5561 aa  58.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  27.08 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>