40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1796 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 694 aa  1407    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  65.42 
 
 		 1096 aa  621  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  64.64 
 
 		 827 aa  608  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  44.03 
 
 		 696 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  37.77 
 
 		 1219 aa  265  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1804 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  36.07 
 
 		 2042 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  34.43 
 
 		 899 aa  89.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  32.42 
 
 		 937 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  30.62 
 
 		 898 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  33.33 
 
 		 913 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1902 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  32.11 
 
 		 906 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  30.3 
 
 		 888 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  38.27 
 
 		 1241 aa  64.3  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1474  hypothetical protein  36.46 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  28.36 
 
 		 2192 aa  58.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  32.52 
 
 		 549 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  26.47 
 
 		 1224 aa  57  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  31.82 
 
 		 3586 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.41 
 
 		 1919 aa  55.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  34.75 
 
 		 3325 aa  53.9  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  29.84 
 
 		 1887 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  32.57 
 
 		 1222 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  29.55 
 
 		 675 aa  52  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  35.12 
 
 		 777 aa  51.2  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  38.24 
 
 		 983 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  26.67 
 
 		 1047 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  30.48 
 
 		 482 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1439 aa  48.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  33.82 
 
 		 916 aa  48.1  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  32.5 
 
 		 2528 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  29.95 
 
 		 1951 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  36.72 
 
 		 1496 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  47.83 
 
 		 1588 aa  45.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  30.34 
 
 		 340 aa  45.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  27.54 
 
 		 762 aa  45.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  35.05 
 
 		 3861 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  32.14 
 
 		 1307 aa  44.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24530  hypothetical protein  27.82 
 
 		 504 aa  43.9  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.49378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>