57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0747 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  100 
 
 		 1241 aa  2435    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  40.67 
 
 		 983 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3555  hypothetical protein  43.05 
 
 		 616 aa  284  8.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507708  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  36.17 
 
 		 690 aa  221  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1877  hypothetical protein  35.34 
 
 		 607 aa  177  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215725  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  35.68 
 
 		 1323 aa  164  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0433  hypothetical protein  28.49 
 
 		 568 aa  137  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.701978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  28.6 
 
 		 642 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  28.69 
 
 		 653 aa  120  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3273  hypothetical protein  32.52 
 
 		 587 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000120347  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  63.81 
 
 		 2042 aa  119  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  77.14 
 
 		 1804 aa  114  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  25.7 
 
 		 635 aa  104  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3274  hypothetical protein  28.54 
 
 		 587 aa  104  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000551776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  38.35 
 
 		 1275 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  49.11 
 
 		 1439 aa  102  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  55.7 
 
 		 913 aa  89.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  32.56 
 
 		 937 aa  85.1  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0098  Cna B domain-containing protein  45.37 
 
 		 138 aa  85.1  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.685071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  57.97 
 
 		 1902 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  40.71 
 
 		 1585 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  50.62 
 
 		 888 aa  78.6  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  45.83 
 
 		 898 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  31.95 
 
 		 2296 aa  76.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  37.93 
 
 		 1588 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0452  NHL repeat-containing protein  40.37 
 
 		 525 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  51.43 
 
 		 906 aa  72.8  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  43.48 
 
 		 899 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3284  hypothetical protein  26.63 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.323692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  34.42 
 
 		 1490 aa  68.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  28.66 
 
 		 550 aa  67.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  52.11 
 
 		 482 aa  66.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  38.27 
 
 		 694 aa  64.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  31.75 
 
 		 1207 aa  63.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  49.41 
 
 		 4500 aa  62.4  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  50 
 
 		 2927 aa  60.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  46.67 
 
 		 2192 aa  59.3  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  32.22 
 
 		 6272 aa  59.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  27.76 
 
 		 1047 aa  57.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  40.54 
 
 		 696 aa  57.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.25 
 
 		 1383 aa  55.5  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  41.05 
 
 		 1526 aa  55.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0941  hypothetical protein  32.65 
 
 		 791 aa  54.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.10709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  52.33 
 
 		 1848 aa  53.5  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1712  hypothetical protein  38.27 
 
 		 235 aa  52.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1535  hypothetical protein  28.87 
 
 		 242 aa  52  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0321654  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  35.43 
 
 		 870 aa  50.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  34.85 
 
 		 1371 aa  50.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  42.86 
 
 		 1245 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4395  NHL repeat containing protein  37.97 
 
 		 236 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332855  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0105  protease-like  40.82 
 
 		 1478 aa  48.9  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  29.91 
 
 		 857 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0071  hypothetical protein  35.43 
 
 		 1034 aa  47  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  44.07 
 
 		 471 aa  46.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  38.04 
 
 		 1994 aa  45.8  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0459  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.4 
 
 		 1193 aa  45.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245222  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  29.17 
 
 		 1126 aa  44.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>