110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1320 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  100 
 
 		 777 aa  1546    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  69.18 
 
 		 916 aa  557  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  59.51 
 
 		 549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  63.77 
 
 		 534 aa  306  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  54.32 
 
 		 2042 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  42.71 
 
 		 1951 aa  265  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  50 
 
 		 1804 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  45.21 
 
 		 2528 aa  233  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  50 
 
 		 1141 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  43.38 
 
 		 2192 aa  202  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  35.97 
 
 		 1902 aa  188  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  43.2 
 
 		 1496 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  41.29 
 
 		 899 aa  171  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  50.42 
 
 		 1439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  38.41 
 
 		 1585 aa  162  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  39.92 
 
 		 898 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  36.64 
 
 		 1588 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  34.77 
 
 		 913 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  37.18 
 
 		 827 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  44.62 
 
 		 675 aa  131  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  32.25 
 
 		 1096 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  32.02 
 
 		 937 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1538 aa  124  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  36.84 
 
 		 888 aa  121  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  34.38 
 
 		 906 aa  105  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  50 
 
 		 2178 aa  93.6  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  44.14 
 
 		 2002 aa  89.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  40.84 
 
 		 577 aa  89.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  33.78 
 
 		 3586 aa  88.2  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  32.17 
 
 		 2117 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  29.44 
 
 		 3925 aa  84.3  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  33.02 
 
 		 499 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  32.89 
 
 		 6109 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  39.6 
 
 		 1537 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  31.19 
 
 		 711 aa  75.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  24.02 
 
 		 1332 aa  75.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  26.32 
 
 		 831 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  31.68 
 
 		 1047 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  50.57 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  33.55 
 
 		 4689 aa  70.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  31.02 
 
 		 1219 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  31.02 
 
 		 606 aa  68.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  32.09 
 
 		 1461 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  29.21 
 
 		 2552 aa  66.6  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  28.72 
 
 		 1621 aa  66.2  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  29.64 
 
 		 1152 aa  61.6  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  36.93 
 
 		 482 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  30.58 
 
 		 3824 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  32.57 
 
 		 696 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  29.48 
 
 		 3824 aa  58.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  40.95 
 
 		 2030 aa  57.4  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1457 aa  56.2  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  30 
 
 		 5442 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  31.89 
 
 		 3824 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  35.42 
 
 		 2170 aa  55.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  23.78 
 
 		 1795 aa  55.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  30 
 
 		 5839 aa  54.7  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  34.91 
 
 		 2350 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  27.73 
 
 		 4791 aa  54.3  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  33.04 
 
 		 694 aa  54.3  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  31.69 
 
 		 4106 aa  53.9  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  40.38 
 
 		 1613 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1657 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  25.82 
 
 		 892 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  23.98 
 
 		 820 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  30.27 
 
 		 2704 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  28.98 
 
 		 4874 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  29.86 
 
 		 3861 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  28.21 
 
 		 3721 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  35.63 
 
 		 558 aa  52  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  31.62 
 
 		 739 aa  52  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.93 
 
 		 1919 aa  51.2  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  43.88 
 
 		 655 aa  51.2  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  28.06 
 
 		 3739 aa  50.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2793  hypothetical protein  26.11 
 
 		 574 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.430464  hitchhiker  0.000384805 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  26 
 
 		 1570 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  22.85 
 
 		 805 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  31.3 
 
 		 4761 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  32.87 
 
 		 1887 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  26.9 
 
 		 7149 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.84 
 
 		 1726 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  29.47 
 
 		 793 aa  50.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  27.24 
 
 		 5559 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  35.61 
 
 		 3562 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.97 
 
 		 587 aa  49.3  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  34.88 
 
 		 1748 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  31.07 
 
 		 3325 aa  48.9  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  27.24 
 
 		 5559 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  27.24 
 
 		 5561 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  30.6 
 
 		 895 aa  48.9  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  27.24 
 
 		 5561 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  27.24 
 
 		 5561 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  25.6 
 
 		 1570 aa  47.8  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  29.3 
 
 		 2768 aa  47.8  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0600  hypothetical protein  35.09 
 
 		 531 aa  47.8  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  34.72 
 
 		 606 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  22.9 
 
 		 1224 aa  47.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.52 
 
 		 6683 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0784  hypothetical protein  26.49 
 
 		 190 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  27.95 
 
 		 1695 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>