49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0648 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 1795 aa  3635    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  29.76 
 
 		 653 aa  122  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  26.92 
 
 		 2552 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 		 3333 aa  108  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  31.97 
 
 		 2344 aa  108  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.99 
 
 		 795 aa  96.3  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  22.71 
 
 		 5743 aa  92.8  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1657 aa  92  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1792 aa  85.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  29.48 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3358  hypothetical protein  37.08 
 
 		 743 aa  78.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0199152 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  25.82 
 
 		 1172 aa  76.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 1505 aa  72  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  31.1 
 
 		 680 aa  70.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  27.23 
 
 		 1141 aa  71.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  22.33 
 
 		 680 aa  70.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  34.18 
 
 		 1121 aa  68.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  32.65 
 
 		 782 aa  68.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  31.52 
 
 		 692 aa  66.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1664  hypothetical protein  26.04 
 
 		 346 aa  63.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000631476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.06 
 
 		 6885 aa  61.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  24.12 
 
 		 1042 aa  61.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  25 
 
 		 1457 aa  59.3  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  29.01 
 
 		 656 aa  58.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1825 aa  57.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5269  Fibronectin type III domain protein  23.75 
 
 		 1633 aa  57.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  25 
 
 		 744 aa  57  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  34.88 
 
 		 648 aa  56.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  25.3 
 
 		 2068 aa  56.6  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  27.76 
 
 		 683 aa  56.2  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  26.16 
 
 		 1221 aa  54.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  25.41 
 
 		 714 aa  54.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  31.31 
 
 		 1160 aa  54.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  31.32 
 
 		 3802 aa  53.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4291  Fibronectin type III domain protein  26.74 
 
 		 2603 aa  53.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  23.78 
 
 		 777 aa  50.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  26.83 
 
 		 1880 aa  50.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  30.11 
 
 		 1067 aa  49.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4301  Fibronectin type III domain protein  27.22 
 
 		 1799 aa  49.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.130951  decreased coverage  0.00087761 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  26.01 
 
 		 1695 aa  49.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  30.72 
 
 		 2170 aa  49.7  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  26.31 
 
 		 3793 aa  48.9  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  22.29 
 
 		 2704 aa  48.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  27.44 
 
 		 635 aa  48.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  25.73 
 
 		 2000 aa  48.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  24.84 
 
 		 1462 aa  47.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  23.63 
 
 		 2122 aa  47.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  29.47 
 
 		 3227 aa  45.8  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  28.77 
 
 		 762 aa  45.8  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>