89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1491 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  100 
 
 		 2344 aa  4621    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  35 
 
 		 1634 aa  388  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  28.84 
 
 		 2402 aa  202  7.999999999999999e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  29.56 
 
 		 3089 aa  186  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  40.31 
 
 		 2487 aa  157  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.66 
 
 		 919 aa  147  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  48.39 
 
 		 1853 aa  146  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.4 
 
 		 985 aa  144  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  28.29 
 
 		 2588 aa  144  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  43.87 
 
 		 857 aa  140  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.38 
 
 		 938 aa  135  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44 
 
 		 887 aa  130  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.87 
 
 		 6885 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  29.17 
 
 		 4071 aa  115  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  38 
 
 		 1546 aa  112  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  31.97 
 
 		 1795 aa  108  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  40.38 
 
 		 522 aa  108  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  36.67 
 
 		 308 aa  99.4  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  35.63 
 
 		 671 aa  97.8  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.67 
 
 		 833 aa  97.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  30.04 
 
 		 2833 aa  97.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  40.67 
 
 		 1294 aa  97.1  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  40.67 
 
 		 1414 aa  97.1  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  40.67 
 
 		 1369 aa  95.9  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  40.67 
 
 		 1478 aa  95.5  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  40.67 
 
 		 1759 aa  95.1  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  40.67 
 
 		 1904 aa  94.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  36.25 
 
 		 505 aa  92.8  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  42.86 
 
 		 1017 aa  93.2  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  35.62 
 
 		 505 aa  92  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  32.03 
 
 		 1050 aa  87.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1792 aa  88.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1588  Outer membrane autotransporter barrel  32.43 
 
 		 1184 aa  85.9  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  35.4 
 
 		 1013 aa  82.8  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  37.01 
 
 		 1209 aa  82  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  37.86 
 
 		 1298 aa  80.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  35.81 
 
 		 658 aa  80.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  33.79 
 
 		 473 aa  80.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  30.54 
 
 		 486 aa  80.1  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  39.16 
 
 		 678 aa  80.1  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  39.16 
 
 		 656 aa  79.3  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  35.4 
 
 		 928 aa  79  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  37.09 
 
 		 1121 aa  78.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  32.88 
 
 		 728 aa  76.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  37.32 
 
 		 763 aa  75.5  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  37.32 
 
 		 1137 aa  73.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  28.41 
 
 		 2239 aa  73.2  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  35.57 
 
 		 949 aa  72.8  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 		 1224 aa  72.8  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  36.67 
 
 		 961 aa  72.8  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  32.53 
 
 		 1806 aa  72.8  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  31.86 
 
 		 653 aa  72.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  31.76 
 
 		 619 aa  72  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  22.44 
 
 		 4231 aa  72  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  28.57 
 
 		 3278 aa  66.6  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  26.35 
 
 		 467 aa  66.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  50 
 
 		 525 aa  64.7  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  32.02 
 
 		 2848 aa  64.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 		 660 aa  62  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  34.97 
 
 		 2670 aa  62  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.39 
 
 		 3816 aa  62.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  28.99 
 
 		 1008 aa  61.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.42 
 
 		 1505 aa  60.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0210  C protein alpha-antigen  27.11 
 
 		 730 aa  57.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  25.56 
 
 		 714 aa  57.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.71 
 
 		 2839 aa  56.2  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  26.98 
 
 		 886 aa  55.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1664  hypothetical protein  27.06 
 
 		 346 aa  54.3  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000631476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  28.85 
 
 		 891 aa  53.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000442231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  26.72 
 
 		 890 aa  53.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  33.83 
 
 		 2153 aa  53.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  27.35 
 
 		 891 aa  52  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000636329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5267  PKD domain containing protein  36 
 
 		 426 aa  52.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1121 aa  52.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.57 
 
 		 503 aa  51.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  28.89 
 
 		 1224 aa  50.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.56 
 
 		 3699 aa  50.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  31.82 
 
 		 2503 aa  50.1  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2534  neutral protease  25.7 
 
 		 887 aa  49.3  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.596256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  25.97 
 
 		 2522 aa  48.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  28.98 
 
 		 1911 aa  48.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  27.22 
 
 		 2476 aa  49.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  30.56 
 
 		 3699 aa  49.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.85 
 
 		 3089 aa  48.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  28.22 
 
 		 3544 aa  47.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  26.51 
 
 		 884 aa  47  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011855 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  26.97 
 
 		 2552 aa  46.6  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  28.1 
 
 		 2715 aa  46.6  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2393  thermolysin metallopeptidase  25.9 
 
 		 530 aa  46.2  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>