182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2760 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  74.34 
 
 
949 aa  1523    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  49.73 
 
 
984 aa  740    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  56.46 
 
 
928 aa  1013    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  53.39 
 
 
757 aa  763    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
961 aa  2007    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  48.5 
 
 
854 aa  629  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  47.07 
 
 
894 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  40.26 
 
 
789 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  43.21 
 
 
611 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  37.15 
 
 
778 aa  435  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.6 
 
 
887 aa  429  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  37.52 
 
 
707 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  38.72 
 
 
686 aa  412  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  37.5 
 
 
526 aa  335  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  32.92 
 
 
742 aa  335  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  33.9 
 
 
730 aa  329  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  29.9 
 
 
846 aa  327  9e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  33.47 
 
 
1369 aa  325  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  31.51 
 
 
736 aa  319  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  31.63 
 
 
710 aa  319  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  33.14 
 
 
1759 aa  317  7e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  32.51 
 
 
739 aa  313  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  32.25 
 
 
715 aa  312  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  32.63 
 
 
725 aa  309  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  36.83 
 
 
563 aa  308  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  33.33 
 
 
880 aa  307  6e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.18 
 
 
985 aa  300  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  31.87 
 
 
737 aa  293  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  30.91 
 
 
794 aa  289  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  31.49 
 
 
990 aa  284  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  31.11 
 
 
847 aa  278  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  30.12 
 
 
1137 aa  263  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  29.35 
 
 
1017 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  34.65 
 
 
1478 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  33.33 
 
 
1414 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  39.2 
 
 
522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  35.66 
 
 
1224 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  37.28 
 
 
857 aa  109  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  37.66 
 
 
1294 aa  107  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  25 
 
 
978 aa  107  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  37.66 
 
 
1904 aa  107  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.01 
 
 
833 aa  106  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  33.06 
 
 
658 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
1121 aa  102  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  38 
 
 
763 aa  100  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.14 
 
 
919 aa  98.6  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  35.33 
 
 
671 aa  97.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  37.33 
 
 
1209 aa  96.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  36.67 
 
 
1298 aa  95.5  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  24.42 
 
 
2042 aa  95.1  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.29 
 
 
938 aa  94.7  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  34.67 
 
 
505 aa  94.4  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  35.33 
 
 
678 aa  94  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  35.33 
 
 
656 aa  93.2  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  33.53 
 
 
505 aa  91.7  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  37.34 
 
 
308 aa  88.2  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  34.25 
 
 
1853 aa  85.1  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  64.18 
 
 
591 aa  84  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  33.75 
 
 
1546 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  24.33 
 
 
646 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  33.59 
 
 
473 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  58.82 
 
 
415 aa  79  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  32.5 
 
 
660 aa  79  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  51.43 
 
 
590 aa  78.2  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  29.49 
 
 
467 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  22.41 
 
 
649 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  45.65 
 
 
900 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  57.81 
 
 
922 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  60.29 
 
 
965 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  56.25 
 
 
554 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  36.67 
 
 
2344 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  57.38 
 
 
571 aa  72.4  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  60.66 
 
 
484 aa  72  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  55.38 
 
 
580 aa  72  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  52.94 
 
 
948 aa  72  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  55.88 
 
 
567 aa  72  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  31.37 
 
 
619 aa  71.2  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  54.84 
 
 
773 aa  71.2  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  51.47 
 
 
814 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  33.12 
 
 
1050 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  60 
 
 
683 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.36 
 
 
411 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  53.62 
 
 
873 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  59.38 
 
 
630 aa  69.7  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  25 
 
 
590 aa  68.9  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  54.69 
 
 
820 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  24.36 
 
 
885 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  36.8 
 
 
1601 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  49.38 
 
 
837 aa  67  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 
728 aa  66.6  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  46.27 
 
 
423 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  50.75 
 
 
600 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  51.56 
 
 
334 aa  66.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  46.67 
 
 
391 aa  66.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  51.56 
 
 
425 aa  65.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  49.25 
 
 
563 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  53.73 
 
 
679 aa  65.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  52.31 
 
 
928 aa  65.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  45.07 
 
 
746 aa  65.1  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  54.69 
 
 
710 aa  65.1  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>