266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0413 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  46.56 
 
 
885 aa  734    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  87.08 
 
 
895 aa  1501    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
1224 aa  2539    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  44.55 
 
 
874 aa  689    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.33 
 
 
927 aa  594  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  52.58 
 
 
812 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  41.55 
 
 
1100 aa  534  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.59 
 
 
998 aa  530  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  45.62 
 
 
864 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  41.83 
 
 
875 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.08 
 
 
762 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  47.36 
 
 
775 aa  501  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  41.44 
 
 
851 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.39 
 
 
867 aa  465  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  37 
 
 
1105 aa  464  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.41 
 
 
786 aa  463  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.06 
 
 
611 aa  344  5.999999999999999e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.28 
 
 
582 aa  278  6e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  31.91 
 
 
587 aa  259  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  29.11 
 
 
571 aa  254  8.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  31.43 
 
 
854 aa  251  7e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  29.92 
 
 
591 aa  239  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  30.73 
 
 
578 aa  238  5.0000000000000005e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 
649 aa  219  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  27.18 
 
 
646 aa  201  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 
928 aa  200  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 
1601 aa  189  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  27.39 
 
 
537 aa  172  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  27.1 
 
 
833 aa  165  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.44 
 
 
900 aa  137  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  26.51 
 
 
739 aa  128  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.88 
 
 
887 aa  118  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  35.66 
 
 
961 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  35.4 
 
 
949 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  36.87 
 
 
707 aa  115  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  33.87 
 
 
1152 aa  107  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  41.33 
 
 
1121 aa  107  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  24.96 
 
 
665 aa  105  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  41.89 
 
 
656 aa  105  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  41.89 
 
 
678 aa  105  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 
632 aa  104  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  42.57 
 
 
763 aa  104  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  41.89 
 
 
1298 aa  104  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  34.92 
 
 
1406 aa  102  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  41.22 
 
 
1209 aa  101  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  41.89 
 
 
1137 aa  100  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  27.13 
 
 
803 aa  97.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  61.54 
 
 
741 aa  93.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  24.66 
 
 
978 aa  92.8  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  33.91 
 
 
736 aa  91.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  35.57 
 
 
1017 aa  90.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  24.56 
 
 
606 aa  88.2  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  36.43 
 
 
473 aa  87.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 
660 aa  87.4  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  30.94 
 
 
846 aa  87  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  59.7 
 
 
477 aa  87  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  55.95 
 
 
922 aa  86.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  32 
 
 
522 aa  85.9  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  53.16 
 
 
563 aa  86.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  34.64 
 
 
1127 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  29.61 
 
 
467 aa  85.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  32.22 
 
 
1127 aa  85.1  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.9 
 
 
857 aa  84.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  33.11 
 
 
1294 aa  83.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  33.11 
 
 
1414 aa  84  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  30.81 
 
 
1146 aa  82.8  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  33.11 
 
 
1478 aa  83.2  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  32.97 
 
 
846 aa  82.8  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  33.11 
 
 
1369 aa  82.8  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  54.41 
 
 
566 aa  82.8  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  26.87 
 
 
2042 aa  82.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  42.22 
 
 
1051 aa  82.8  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  33.11 
 
 
1904 aa  82.4  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  33.11 
 
 
1759 aa  82  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  32 
 
 
505 aa  82  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  29.63 
 
 
846 aa  82  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  33.13 
 
 
1127 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.1 
 
 
919 aa  80.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  48.75 
 
 
554 aa  80.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  43.81 
 
 
789 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.89 
 
 
833 aa  80.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  40.78 
 
 
1054 aa  80.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  54.41 
 
 
537 aa  79.7  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  39.81 
 
 
1053 aa  79.3  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  28.76 
 
 
1219 aa  79  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  54.41 
 
 
639 aa  78.2  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  23.48 
 
 
1076 aa  78.2  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 
1127 aa  78.2  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  32.26 
 
 
725 aa  77.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.2 
 
 
985 aa  78.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  31.55 
 
 
1123 aa  77  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  31.91 
 
 
848 aa  77  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  54.41 
 
 
411 aa  76.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  33.53 
 
 
499 aa  76.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  28.91 
 
 
1129 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  30.26 
 
 
2344 aa  76.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 
739 aa  76.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  36.42 
 
 
730 aa  76.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  23.99 
 
 
621 aa  76.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  30 
 
 
686 aa  76.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>