113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1071 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 728 aa  1486    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  41.6 
 
 		 532 aa  361  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  41.37 
 
 		 469 aa  322  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  32.58 
 
 		 815 aa  261  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35.01 
 
 		 584 aa  253  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  33.52 
 
 		 591 aa  252  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.75 
 
 		 558 aa  237  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  30.97 
 
 		 590 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  32.18 
 
 		 583 aa  232  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  32.54 
 
 		 577 aa  230  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  41.06 
 
 		 506 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.78 
 
 		 417 aa  212  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.82 
 
 		 857 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  32.71 
 
 		 315 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  34.85 
 
 		 355 aa  173  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.34 
 
 		 701 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  32.3 
 
 		 342 aa  128  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03326  conserved hypothetical protein  29.08 
 
 		 341 aa  119  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  41.62 
 
 		 1853 aa  117  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.2 
 
 		 887 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.93 
 
 		 506 aa  113  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  29.24 
 
 		 506 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.92 
 
 		 938 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  27.16 
 
 		 694 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.36 
 
 		 985 aa  98.6  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.34 
 
 		 409 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  32.71 
 
 		 313 aa  91.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.75 
 
 		 919 aa  90.9  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  35.53 
 
 		 1546 aa  87  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  36.42 
 
 		 308 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  35.86 
 
 		 1121 aa  83.2  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  30.67 
 
 		 522 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  35.21 
 
 		 763 aa  80.1  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  33.8 
 
 		 656 aa  79.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  31.87 
 
 		 961 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  32.88 
 
 		 2344 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  29.59 
 
 		 671 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 		 928 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  36.91 
 
 		 1478 aa  76.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  36.91 
 
 		 1759 aa  77  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  33.8 
 
 		 678 aa  76.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  36.24 
 
 		 1904 aa  76.6  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  32.61 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  30.68 
 
 		 949 aa  72  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.42 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  44.86 
 
 		 846 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  22.79 
 
 		 364 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.65 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  31.69 
 
 		 711 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  36.42 
 
 		 1414 aa  66.6  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  30.56 
 
 		 658 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  39.27 
 
 		 1369 aa  66.6  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  36.42 
 
 		 1294 aa  65.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  23.89 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  47.95 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  33.56 
 
 		 1209 aa  63.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  29.87 
 
 		 1298 aa  63.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  28.47 
 
 		 473 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  56.52 
 
 		 1281 aa  62.4  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  31.48 
 
 		 505 aa  62  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  29.65 
 
 		 505 aa  62.4  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  58.06 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.82 
 
 		 833 aa  59.7  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  55.56 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  45 
 
 		 914 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  23.81 
 
 		 486 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4674  glycoside hydrolase family 5  34.82 
 
 		 443 aa  54.3  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  61.29 
 
 		 778 aa  52.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  28.28 
 
 		 2073 aa  52  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  27.59 
 
 		 1013 aa  51.6  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  33.88 
 
 		 830 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  30.16 
 
 		 630 aa  51.2  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.93 
 
 		 261 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  32.82 
 
 		 1017 aa  51.2  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.02 
 
 		 445 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  47.69 
 
 		 268 aa  50.8  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  28.28 
 
 		 1224 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.64 
 
 		 790 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  26.45 
 
 		 1050 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  62.16 
 
 		 1409 aa  48.9  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  46.27 
 
 		 555 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  25.33 
 
 		 619 aa  47.8  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  52.54 
 
 		 489 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44203  predicted protein  47.46 
 
 		 658 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  41.18 
 
 		 456 aa  47.4  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 		 660 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  40.62 
 
 		 667 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  56.52 
 
 		 431 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  44.05 
 
 		 253 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  26.29 
 
 		 1000 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0051  peptidoglycan-binding LysM  53.19 
 
 		 436 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.492826  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  40.82 
 
 		 875 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1650  hypothetical protein  39.51 
 
 		 190 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186747  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  47.95 
 
 		 551 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  38.64 
 
 		 521 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  51.72 
 
 		 433 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  43.08 
 
 		 775 aa  45.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45586  predicted protein  44.44 
 
 		 706 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>