30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2491 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 458 aa  902    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  22.73 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.6 
 
 		 558 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  25.09 
 
 		 711 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  27.86 
 
 		 315 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  24.75 
 
 		 815 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.32 
 
 		 584 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  27.08 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.45 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 591 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.32 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  22.27 
 
 		 532 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.11 
 
 		 701 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  29.49 
 
 		 694 aa  67  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.81 
 
 		 383 aa  67  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.79 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.37 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  25.51 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  27.03 
 
 		 577 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  28.83 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.34 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 		 728 aa  63.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  30.71 
 
 		 583 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.92 
 
 		 364 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  27.23 
 
 		 590 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.79 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.68 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33.7 
 
 		 857 aa  53.9  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  31.51 
 
 		 490 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>