36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3032 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  100 
 
 		 385 aa  801    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  71.35 
 
 		 364 aa  568  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  68.64 
 
 		 383 aa  538  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  42.82 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  37.7 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.91 
 
 		 409 aa  256  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  28.81 
 
 		 577 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 		 591 aa  103  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 590 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.93 
 
 		 469 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.84 
 
 		 584 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.82 
 
 		 506 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  25.67 
 
 		 583 aa  90.5  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.87 
 
 		 857 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.87 
 
 		 558 aa  87  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.11 
 
 		 532 aa  87  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.59 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  28.57 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.9 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  27.45 
 
 		 815 aa  69.7  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  21.9 
 
 		 711 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  24.31 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  24.65 
 
 		 728 aa  67  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  23.6 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  23.65 
 
 		 701 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  27.56 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  23.14 
 
 		 694 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  29.66 
 
 		 506 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  22.04 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  31.71 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  31.76 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  31.76 
 
 		 300 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  24.2 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  30.12 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  21.65 
 
 		 409 aa  42.7  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>