76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4471 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  100 
 
 
407 aa  810    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  55.35 
 
 
442 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  54.62 
 
 
415 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  55.35 
 
 
409 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  44.48 
 
 
285 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  44.48 
 
 
300 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  44.4 
 
 
285 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  40.5 
 
 
490 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  36.36 
 
 
520 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  42.29 
 
 
900 aa  166  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  36.98 
 
 
519 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  33.44 
 
 
314 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  32.22 
 
 
334 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  36.05 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  34.51 
 
 
351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  35.1 
 
 
375 aa  130  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  29.43 
 
 
519 aa  119  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
1231 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  24.16 
 
 
533 aa  90.1  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  28.73 
 
 
424 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  30.41 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  27.06 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  27.97 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  29.59 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  25.68 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  28.8 
 
 
644 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  28.81 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  37.72 
 
 
649 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  28.39 
 
 
299 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  24.49 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  27.81 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  27.8 
 
 
620 aa  67.4  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  25.43 
 
 
558 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  40.16 
 
 
429 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  26.74 
 
 
325 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  27 
 
 
314 aa  63.5  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  27.83 
 
 
880 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  31.16 
 
 
314 aa  59.7  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  31.9 
 
 
496 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  23.83 
 
 
367 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  33.33 
 
 
901 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  26.35 
 
 
322 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  29.38 
 
 
314 aa  57  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  30.84 
 
 
443 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  38.71 
 
 
506 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.39 
 
 
886 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  32.41 
 
 
427 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  26.09 
 
 
652 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.34 
 
 
409 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  32.52 
 
 
524 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  30.47 
 
 
360 aa  53.5  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.33 
 
 
383 aa  53.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  33.61 
 
 
605 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  24.73 
 
 
307 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  23.26 
 
 
321 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 
591 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.95 
 
 
558 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  30.26 
 
 
376 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 
506 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  30.49 
 
 
376 aa  49.7  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  39.13 
 
 
694 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  35.37 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.58 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.53 
 
 
380 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  22.58 
 
 
577 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  27.36 
 
 
322 aa  46.6  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3201  hypothetical protein  38.55 
 
 
289 aa  46.6  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00013826  hitchhiker  0.000976632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  30.63 
 
 
580 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  26.7 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  28.68 
 
 
533 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.93 
 
 
584 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.57 
 
 
469 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  33.68 
 
 
342 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.12 
 
 
385 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.56 
 
 
506 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  30.77 
 
 
351 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>