36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0206 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  100 
 
 		 321 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  64.8 
 
 		 325 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  54.52 
 
 		 314 aa  358  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  54.31 
 
 		 314 aa  358  7e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  53.99 
 
 		 314 aa  355  6.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  56.88 
 
 		 322 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  55.11 
 
 		 322 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  45.39 
 
 		 302 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  45.1 
 
 		 299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  48.85 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  36.96 
 
 		 880 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.69 
 
 		 886 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  25.1 
 
 		 558 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  28.72 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  26.38 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  27.03 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  27.03 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  27.03 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  25.93 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  29.22 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  25.99 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  26.36 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  24.33 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  25.25 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  26.26 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  26.98 
 
 		 519 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  24.36 
 
 		 407 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  20.92 
 
 		 1231 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  24.54 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  26.98 
 
 		 620 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  23.23 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  24.87 
 
 		 426 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  20.62 
 
 		 345 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  21.57 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  24.18 
 
 		 429 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  24.75 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>