49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1334 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  83.44 
 
 		 299 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  83.44 
 
 		 302 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  49.02 
 
 		 314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  48.69 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  47.77 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  45.34 
 
 		 321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  48.26 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  48.64 
 
 		 322 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  47.69 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  37.99 
 
 		 880 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.07 
 
 		 886 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  28.26 
 
 		 558 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  30.86 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  28.09 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  29.24 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  29.24 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  27.95 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  29.39 
 
 		 652 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  31.16 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  33.7 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  27.31 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 		 1231 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  27.97 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  22.65 
 
 		 900 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  24.53 
 
 		 519 aa  55.8  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  21.16 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  30.34 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  27 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  26.07 
 
 		 407 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  29.09 
 
 		 429 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  25 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  28.97 
 
 		 357 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  26.09 
 
 		 519 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  24.27 
 
 		 424 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  30.84 
 
 		 443 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  31.79 
 
 		 605 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  25.63 
 
 		 358 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  30.84 
 
 		 427 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  26.06 
 
 		 426 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  25.32 
 
 		 367 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  26.59 
 
 		 533 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  25.9 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  31.25 
 
 		 580 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  29.94 
 
 		 613 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  26.29 
 
 		 496 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  35.48 
 
 		 901 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  21.23 
 
 		 520 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>